Protein–RNA interactions for Protein: O94806

PRKD3, Serine/threonine-protein kinase D3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD3O94806 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKD3O94806 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKD3O94806 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKD3O94806 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKD3O94806 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKD3O94806 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKD3O94806 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKD3O94806 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKD3O94806 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKD3O94806 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKD3O94806 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKD3O94806 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKD3O94806 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKD3O94806 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKD3O94806 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKD3O94806 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKD3O94806 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKD3O94806 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKD3O94806 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKD3O94806 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKD3O94806 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKD3O94806 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKD3O94806 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKD3O94806 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKD3O94806 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKD3O94806 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKD3O94806 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKD3O94806 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKD3O94806 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKD3O94806 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKD3O94806 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKD3O94806 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKD3O94806 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKD3O94806 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD3O94806 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD3O94806 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD3O94806 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD3O94806 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD3O94806 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD3O94806 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKD3O94806 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKD3O94806 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKD3O94806 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKD3O94806 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKD3O94806 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKD3O94806 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKD3O94806 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKD3O94806 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKD3O94806 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKD3O94806 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKD3O94806 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKD3O94806 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKD3O94806 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKD3O94806 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKD3O94806 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKD3O94806 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKD3O94806 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKD3O94806 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKD3O94806 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKD3O94806 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKD3O94806 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKD3O94806 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKD3O94806 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKD3O94806 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKD3O94806 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKD3O94806 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKD3O94806 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKD3O94806 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKD3O94806 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKD3O94806 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKD3O94806 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRKD3O94806 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKD3O94806 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKD3O94806 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKD3O94806 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKD3O94806 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKD3O94806 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKD3O94806 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKD3O94806 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKD3O94806 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKD3O94806 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKD3O94806 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKD3O94806 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKD3O94806 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKD3O94806 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKD3O94806 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKD3O94806 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKD3O94806 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKD3O94806 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKD3O94806 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKD3O94806 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKD3O94806 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKD3O94806 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKD3O94806 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKD3O94806 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKD3O94806 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKD3O94806 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKD3O94806 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKD3O94806 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKD3O94806 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms