Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SRGAP2O75044 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRGAP2O75044 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRGAP2O75044 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRGAP2O75044 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRGAP2O75044 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRGAP2O75044 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRGAP2O75044 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRGAP2O75044 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRGAP2O75044 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRGAP2O75044 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRGAP2O75044 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRGAP2O75044 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRGAP2O75044 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRGAP2O75044 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRGAP2O75044 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRGAP2O75044 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRGAP2O75044 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SRGAP2O75044 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRGAP2O75044 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SRGAP2O75044 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRGAP2O75044 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRGAP2O75044 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRGAP2O75044 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRGAP2O75044 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRGAP2O75044 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRGAP2O75044 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRGAP2O75044 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRGAP2O75044 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRGAP2O75044 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRGAP2O75044 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRGAP2O75044 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRGAP2O75044 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRGAP2O75044 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRGAP2O75044 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRGAP2O75044 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRGAP2O75044 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRGAP2O75044 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRGAP2O75044 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRGAP2O75044 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRGAP2O75044 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRGAP2O75044 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRGAP2O75044 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SRGAP2O75044 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRGAP2O75044 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRGAP2O75044 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRGAP2O75044 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRGAP2O75044 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SRGAP2O75044 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRGAP2O75044 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP2O75044 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP2O75044 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP2O75044 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP2O75044 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP2O75044 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP2O75044 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP2O75044 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP2O75044 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRGAP2O75044 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRGAP2O75044 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRGAP2O75044 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRGAP2O75044 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRGAP2O75044 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRGAP2O75044 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRGAP2O75044 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRGAP2O75044 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRGAP2O75044 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRGAP2O75044 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRGAP2O75044 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRGAP2O75044 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SRGAP2O75044 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRGAP2O75044 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRGAP2O75044 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRGAP2O75044 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRGAP2O75044 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRGAP2O75044 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRGAP2O75044 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRGAP2O75044 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRGAP2O75044 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRGAP2O75044 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRGAP2O75044 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRGAP2O75044 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRGAP2O75044 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRGAP2O75044 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRGAP2O75044 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRGAP2O75044 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRGAP2O75044 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRGAP2O75044 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRGAP2O75044 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRGAP2O75044 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRGAP2O75044 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGAP2O75044 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGAP2O75044 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRGAP2O75044 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRGAP2O75044 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRGAP2O75044 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRGAP2O75044 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRGAP2O75044 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRGAP2O75044 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRGAP2O75044 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms