Protein–RNA interactions for Protein: O60760

HPGDS, Hematopoietic prostaglandin D synthase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDSO60760 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPGDSO60760 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPGDSO60760 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPGDSO60760 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPGDSO60760 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPGDSO60760 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HPGDSO60760 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPGDSO60760 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPGDSO60760 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPGDSO60760 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPGDSO60760 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPGDSO60760 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPGDSO60760 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPGDSO60760 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPGDSO60760 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPGDSO60760 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPGDSO60760 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPGDSO60760 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPGDSO60760 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPGDSO60760 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPGDSO60760 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPGDSO60760 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPGDSO60760 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPGDSO60760 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPGDSO60760 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPGDSO60760 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPGDSO60760 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPGDSO60760 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPGDSO60760 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPGDSO60760 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPGDSO60760 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPGDSO60760 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPGDSO60760 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPGDSO60760 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPGDSO60760 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPGDSO60760 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPGDSO60760 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPGDSO60760 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPGDSO60760 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPGDSO60760 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPGDSO60760 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPGDSO60760 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPGDSO60760 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPGDSO60760 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPGDSO60760 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPGDSO60760 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPGDSO60760 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPGDSO60760 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPGDSO60760 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPGDSO60760 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPGDSO60760 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPGDSO60760 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPGDSO60760 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HPGDSO60760 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HPGDSO60760 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPGDSO60760 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HPGDSO60760 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPGDSO60760 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPGDSO60760 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPGDSO60760 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPGDSO60760 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPGDSO60760 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPGDSO60760 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPGDSO60760 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPGDSO60760 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HPGDSO60760 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPGDSO60760 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPGDSO60760 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPGDSO60760 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPGDSO60760 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPGDSO60760 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPGDSO60760 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPGDSO60760 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPGDSO60760 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPGDSO60760 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPGDSO60760 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPGDSO60760 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPGDSO60760 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPGDSO60760 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HPGDSO60760 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPGDSO60760 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPGDSO60760 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPGDSO60760 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPGDSO60760 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPGDSO60760 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPGDSO60760 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPGDSO60760 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPGDSO60760 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPGDSO60760 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPGDSO60760 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPGDSO60760 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPGDSO60760 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPGDSO60760 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPGDSO60760 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HPGDSO60760 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HPGDSO60760 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPGDSO60760 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPGDSO60760 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPGDSO60760 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPGDSO60760 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms