Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GMDSO60547 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GMDSO60547 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GMDSO60547 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GMDSO60547 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GMDSO60547 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMDSO60547 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMDSO60547 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMDSO60547 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GMDSO60547 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GMDSO60547 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GMDSO60547 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GMDSO60547 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GMDSO60547 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GMDSO60547 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GMDSO60547 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GMDSO60547 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GMDSO60547 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GMDSO60547 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GMDSO60547 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GMDSO60547 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GMDSO60547 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GMDSO60547 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GMDSO60547 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GMDSO60547 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GMDSO60547 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GMDSO60547 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GMDSO60547 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GMDSO60547 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GMDSO60547 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GMDSO60547 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GMDSO60547 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GMDSO60547 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMDSO60547 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMDSO60547 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMDSO60547 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMDSO60547 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMDSO60547 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMDSO60547 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMDSO60547 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GMDSO60547 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GMDSO60547 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GMDSO60547 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GMDSO60547 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GMDSO60547 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GMDSO60547 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GMDSO60547 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GMDSO60547 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GMDSO60547 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GMDSO60547 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GMDSO60547 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GMDSO60547 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GMDSO60547 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GMDSO60547 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GMDSO60547 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMDSO60547 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMDSO60547 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMDSO60547 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMDSO60547 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMDSO60547 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GMDSO60547 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GMDSO60547 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GMDSO60547 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GMDSO60547 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GMDSO60547 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GMDSO60547 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GMDSO60547 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GMDSO60547 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GMDSO60547 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMDSO60547 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMDSO60547 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMDSO60547 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GMDSO60547 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMDSO60547 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMDSO60547 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMDSO60547 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMDSO60547 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GMDSO60547 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GMDSO60547 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GMDSO60547 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMDSO60547 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMDSO60547 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMDSO60547 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMDSO60547 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GMDSO60547 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GMDSO60547 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GMDSO60547 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GMDSO60547 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GMDSO60547 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GMDSO60547 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GMDSO60547 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GMDSO60547 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GMDSO60547 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GMDSO60547 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GMDSO60547 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GMDSO60547 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GMDSO60547 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GMDSO60547 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GMDSO60547 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GMDSO60547 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms