Protein–RNA interactions for Protein: O60513

B4GALT4, Beta-1,4-galactosyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALT4O60513 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
B4GALT4O60513 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
B4GALT4O60513 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
B4GALT4O60513 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
B4GALT4O60513 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
B4GALT4O60513 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
B4GALT4O60513 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
B4GALT4O60513 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
B4GALT4O60513 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
B4GALT4O60513 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
B4GALT4O60513 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
B4GALT4O60513 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
B4GALT4O60513 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
B4GALT4O60513 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
B4GALT4O60513 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
B4GALT4O60513 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
B4GALT4O60513 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
B4GALT4O60513 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
B4GALT4O60513 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
B4GALT4O60513 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
B4GALT4O60513 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
B4GALT4O60513 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
B4GALT4O60513 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
B4GALT4O60513 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
B4GALT4O60513 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
B4GALT4O60513 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
B4GALT4O60513 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
B4GALT4O60513 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
B4GALT4O60513 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
B4GALT4O60513 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
B4GALT4O60513 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
B4GALT4O60513 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
B4GALT4O60513 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
B4GALT4O60513 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
B4GALT4O60513 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
B4GALT4O60513 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
B4GALT4O60513 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
B4GALT4O60513 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
B4GALT4O60513 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
B4GALT4O60513 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
B4GALT4O60513 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
B4GALT4O60513 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
B4GALT4O60513 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
B4GALT4O60513 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
B4GALT4O60513 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
B4GALT4O60513 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
B4GALT4O60513 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
B4GALT4O60513 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
B4GALT4O60513 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
B4GALT4O60513 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
B4GALT4O60513 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
B4GALT4O60513 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
B4GALT4O60513 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
B4GALT4O60513 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
B4GALT4O60513 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
B4GALT4O60513 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
B4GALT4O60513 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
B4GALT4O60513 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
B4GALT4O60513 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
B4GALT4O60513 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
B4GALT4O60513 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
B4GALT4O60513 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
B4GALT4O60513 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
B4GALT4O60513 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
B4GALT4O60513 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
B4GALT4O60513 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
B4GALT4O60513 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
B4GALT4O60513 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
B4GALT4O60513 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
B4GALT4O60513 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
B4GALT4O60513 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
B4GALT4O60513 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
B4GALT4O60513 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
B4GALT4O60513 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
B4GALT4O60513 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
B4GALT4O60513 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
B4GALT4O60513 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
B4GALT4O60513 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
B4GALT4O60513 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
B4GALT4O60513 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
B4GALT4O60513 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
B4GALT4O60513 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
B4GALT4O60513 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
B4GALT4O60513 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
B4GALT4O60513 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
B4GALT4O60513 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
B4GALT4O60513 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
B4GALT4O60513 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
B4GALT4O60513 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
B4GALT4O60513 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
B4GALT4O60513 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
B4GALT4O60513 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
B4GALT4O60513 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
B4GALT4O60513 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
B4GALT4O60513 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
B4GALT4O60513 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
B4GALT4O60513 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
B4GALT4O60513 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
B4GALT4O60513 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4GALT4O60513 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms