Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MARCH6O60337 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MARCH6O60337 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MARCH6O60337 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
MARCH6O60337 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MARCH6O60337 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MARCH6O60337 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
MARCH6O60337 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
MARCH6O60337 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MARCH6O60337 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MARCH6O60337 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MARCH6O60337 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MARCH6O60337 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MARCH6O60337 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
MARCH6O60337 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MARCH6O60337 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MARCH6O60337 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MARCH6O60337 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MARCH6O60337 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MARCH6O60337 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MARCH6O60337 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
MARCH6O60337 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MARCH6O60337 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MARCH6O60337 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MARCH6O60337 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MARCH6O60337 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
MARCH6O60337 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MARCH6O60337 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MARCH6O60337 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MARCH6O60337 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MARCH6O60337 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MARCH6O60337 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MARCH6O60337 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms