Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KIF1CO43896 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KIF1CO43896 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KIF1CO43896 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF1CO43896 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF1CO43896 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF1CO43896 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF1CO43896 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF1CO43896 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF1CO43896 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF1CO43896 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF1CO43896 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF1CO43896 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KIF1CO43896 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KIF1CO43896 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KIF1CO43896 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF1CO43896 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF1CO43896 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF1CO43896 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KIF1CO43896 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KIF1CO43896 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KIF1CO43896 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KIF1CO43896 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KIF1CO43896 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
KIF1CO43896 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KIF1CO43896 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KIF1CO43896 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KIF1CO43896 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
KIF1CO43896 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KIF1CO43896 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KIF1CO43896 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KIF1CO43896 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KIF1CO43896 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KIF1CO43896 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIF1CO43896 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIF1CO43896 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIF1CO43896 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIF1CO43896 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIF1CO43896 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KIF1CO43896 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIF1CO43896 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIF1CO43896 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIF1CO43896 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIF1CO43896 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KIF1CO43896 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KIF1CO43896 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KIF1CO43896 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIF1CO43896 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIF1CO43896 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIF1CO43896 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIF1CO43896 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIF1CO43896 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KIF1CO43896 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIF1CO43896 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIF1CO43896 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIF1CO43896 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIF1CO43896 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIF1CO43896 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIF1CO43896 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIF1CO43896 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIF1CO43896 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIF1CO43896 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIF1CO43896 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIF1CO43896 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIF1CO43896 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIF1CO43896 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIF1CO43896 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIF1CO43896 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIF1CO43896 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIF1CO43896 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIF1CO43896 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIF1CO43896 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KIF1CO43896 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KIF1CO43896 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KIF1CO43896 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KIF1CO43896 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms