Protein–RNA interactions for Protein: O43325

LYRM1, LYR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM1O43325 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYRM1O43325 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYRM1O43325 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYRM1O43325 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYRM1O43325 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYRM1O43325 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYRM1O43325 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYRM1O43325 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYRM1O43325 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYRM1O43325 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYRM1O43325 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYRM1O43325 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LYRM1O43325 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYRM1O43325 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYRM1O43325 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYRM1O43325 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYRM1O43325 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYRM1O43325 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYRM1O43325 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYRM1O43325 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYRM1O43325 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYRM1O43325 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYRM1O43325 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYRM1O43325 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYRM1O43325 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYRM1O43325 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYRM1O43325 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYRM1O43325 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LYRM1O43325 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYRM1O43325 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYRM1O43325 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYRM1O43325 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYRM1O43325 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYRM1O43325 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYRM1O43325 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYRM1O43325 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LYRM1O43325 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LYRM1O43325 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYRM1O43325 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYRM1O43325 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYRM1O43325 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYRM1O43325 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYRM1O43325 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYRM1O43325 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYRM1O43325 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYRM1O43325 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYRM1O43325 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYRM1O43325 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYRM1O43325 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYRM1O43325 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYRM1O43325 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYRM1O43325 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYRM1O43325 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LYRM1O43325 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LYRM1O43325 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYRM1O43325 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYRM1O43325 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYRM1O43325 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYRM1O43325 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYRM1O43325 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYRM1O43325 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYRM1O43325 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYRM1O43325 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYRM1O43325 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYRM1O43325 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYRM1O43325 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYRM1O43325 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYRM1O43325 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYRM1O43325 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYRM1O43325 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYRM1O43325 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYRM1O43325 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYRM1O43325 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYRM1O43325 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYRM1O43325 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYRM1O43325 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYRM1O43325 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYRM1O43325 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYRM1O43325 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYRM1O43325 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYRM1O43325 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYRM1O43325 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYRM1O43325 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYRM1O43325 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYRM1O43325 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYRM1O43325 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYRM1O43325 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYRM1O43325 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYRM1O43325 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYRM1O43325 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYRM1O43325 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYRM1O43325 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LYRM1O43325 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYRM1O43325 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYRM1O43325 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYRM1O43325 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYRM1O43325 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYRM1O43325 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYRM1O43325 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYRM1O43325 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms