Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNB1O43157 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXNB1O43157 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLXNB1O43157 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLXNB1O43157 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLXNB1O43157 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXNB1O43157 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLXNB1O43157 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PLXNB1O43157 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLXNB1O43157 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLXNB1O43157 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PLXNB1O43157 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PLXNB1O43157 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLXNB1O43157 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PLXNB1O43157 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PLXNB1O43157 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PLXNB1O43157 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNB1O43157 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNB1O43157 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PLXNB1O43157 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNB1O43157 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PLXNB1O43157 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLXNB1O43157 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLXNB1O43157 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLXNB1O43157 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLXNB1O43157 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLXNB1O43157 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLXNB1O43157 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLXNB1O43157 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLXNB1O43157 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLXNB1O43157 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLXNB1O43157 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PLXNB1O43157 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXNB1O43157 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXNB1O43157 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXNB1O43157 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXNB1O43157 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLXNB1O43157 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLXNB1O43157 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLXNB1O43157 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLXNB1O43157 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLXNB1O43157 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLXNB1O43157 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLXNB1O43157 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLXNB1O43157 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLXNB1O43157 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLXNB1O43157 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLXNB1O43157 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLXNB1O43157 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLXNB1O43157 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLXNB1O43157 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PLXNB1O43157 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLXNB1O43157 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLXNB1O43157 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLXNB1O43157 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLXNB1O43157 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PLXNB1O43157 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLXNB1O43157 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLXNB1O43157 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLXNB1O43157 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLXNB1O43157 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXNB1O43157 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXNB1O43157 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXNB1O43157 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXNB1O43157 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXNB1O43157 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXNB1O43157 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXNB1O43157 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXNB1O43157 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXNB1O43157 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXNB1O43157 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXNB1O43157 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PLXNB1O43157 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLXNB1O43157 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLXNB1O43157 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms