Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLOCKO15516 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLOCKO15516 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLOCKO15516 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLOCKO15516 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLOCKO15516 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLOCKO15516 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLOCKO15516 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLOCKO15516 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLOCKO15516 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLOCKO15516 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLOCKO15516 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLOCKO15516 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLOCKO15516 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLOCKO15516 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLOCKO15516 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLOCKO15516 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLOCKO15516 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLOCKO15516 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLOCKO15516 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLOCKO15516 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLOCKO15516 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CLOCKO15516 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLOCKO15516 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLOCKO15516 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLOCKO15516 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLOCKO15516 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLOCKO15516 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CLOCKO15516 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLOCKO15516 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CLOCKO15516 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLOCKO15516 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLOCKO15516 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLOCKO15516 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLOCKO15516 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLOCKO15516 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLOCKO15516 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLOCKO15516 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLOCKO15516 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLOCKO15516 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLOCKO15516 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLOCKO15516 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLOCKO15516 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLOCKO15516 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLOCKO15516 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLOCKO15516 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLOCKO15516 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLOCKO15516 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLOCKO15516 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLOCKO15516 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLOCKO15516 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLOCKO15516 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLOCKO15516 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLOCKO15516 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CLOCKO15516 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLOCKO15516 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLOCKO15516 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLOCKO15516 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLOCKO15516 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLOCKO15516 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLOCKO15516 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLOCKO15516 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLOCKO15516 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLOCKO15516 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLOCKO15516 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLOCKO15516 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLOCKO15516 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLOCKO15516 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLOCKO15516 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLOCKO15516 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLOCKO15516 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLOCKO15516 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLOCKO15516 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLOCKO15516 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLOCKO15516 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLOCKO15516 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLOCKO15516 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLOCKO15516 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLOCKO15516 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CLOCKO15516 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLOCKO15516 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLOCKO15516 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLOCKO15516 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLOCKO15516 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLOCKO15516 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLOCKO15516 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLOCKO15516 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLOCKO15516 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLOCKO15516 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLOCKO15516 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLOCKO15516 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLOCKO15516 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLOCKO15516 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLOCKO15516 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLOCKO15516 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLOCKO15516 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLOCKO15516 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLOCKO15516 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLOCKO15516 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLOCKO15516 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms