Protein–RNA interactions for Protein: O14656

TOR1A, Torsin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1AO14656 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOR1AO14656 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOR1AO14656 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOR1AO14656 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOR1AO14656 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOR1AO14656 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TOR1AO14656 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOR1AO14656 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOR1AO14656 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOR1AO14656 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOR1AO14656 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOR1AO14656 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOR1AO14656 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOR1AO14656 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOR1AO14656 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOR1AO14656 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOR1AO14656 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOR1AO14656 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOR1AO14656 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOR1AO14656 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOR1AO14656 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOR1AO14656 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOR1AO14656 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOR1AO14656 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOR1AO14656 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOR1AO14656 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TOR1AO14656 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOR1AO14656 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOR1AO14656 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOR1AO14656 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOR1AO14656 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOR1AO14656 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOR1AO14656 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOR1AO14656 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TOR1AO14656 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOR1AO14656 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOR1AO14656 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOR1AO14656 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOR1AO14656 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOR1AO14656 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOR1AO14656 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOR1AO14656 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOR1AO14656 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOR1AO14656 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOR1AO14656 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOR1AO14656 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOR1AO14656 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOR1AO14656 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOR1AO14656 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOR1AO14656 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOR1AO14656 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOR1AO14656 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOR1AO14656 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TOR1AO14656 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOR1AO14656 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOR1AO14656 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOR1AO14656 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOR1AO14656 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOR1AO14656 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOR1AO14656 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOR1AO14656 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOR1AO14656 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOR1AO14656 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOR1AO14656 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOR1AO14656 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOR1AO14656 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOR1AO14656 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOR1AO14656 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOR1AO14656 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOR1AO14656 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TOR1AO14656 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOR1AO14656 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOR1AO14656 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOR1AO14656 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOR1AO14656 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOR1AO14656 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOR1AO14656 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOR1AO14656 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOR1AO14656 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOR1AO14656 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOR1AO14656 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOR1AO14656 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOR1AO14656 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TOR1AO14656 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOR1AO14656 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOR1AO14656 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOR1AO14656 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOR1AO14656 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOR1AO14656 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOR1AO14656 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOR1AO14656 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOR1AO14656 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOR1AO14656 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOR1AO14656 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOR1AO14656 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOR1AO14656 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TOR1AO14656 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOR1AO14656 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOR1AO14656 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TOR1AO14656 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms