Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PEX7O00628 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX7O00628 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX7O00628 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX7O00628 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX7O00628 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX7O00628 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX7O00628 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX7O00628 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX7O00628 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX7O00628 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX7O00628 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX7O00628 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX7O00628 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX7O00628 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX7O00628 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX7O00628 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX7O00628 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX7O00628 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX7O00628 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX7O00628 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PEX7O00628 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PEX7O00628 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX7O00628 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX7O00628 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX7O00628 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX7O00628 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX7O00628 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX7O00628 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX7O00628 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX7O00628 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX7O00628 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX7O00628 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX7O00628 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX7O00628 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX7O00628 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX7O00628 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PEX7O00628 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PEX7O00628 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PEX7O00628 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PEX7O00628 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PEX7O00628 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX7O00628 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX7O00628 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX7O00628 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX7O00628 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX7O00628 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX7O00628 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX7O00628 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX7O00628 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX7O00628 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX7O00628 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX7O00628 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX7O00628 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX7O00628 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX7O00628 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PEX7O00628 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PEX7O00628 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX7O00628 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX7O00628 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX7O00628 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX7O00628 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX7O00628 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX7O00628 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX7O00628 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX7O00628 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX7O00628 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX7O00628 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX7O00628 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX7O00628 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX7O00628 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX7O00628 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX7O00628 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PEX7O00628 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PEX7O00628 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PEX7O00628 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX7O00628 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX7O00628 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX7O00628 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX7O00628 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX7O00628 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX7O00628 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX7O00628 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX7O00628 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX7O00628 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX7O00628 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX7O00628 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX7O00628 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX7O00628 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX7O00628 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX7O00628 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX7O00628 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX7O00628 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PEX7O00628 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PEX7O00628 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX7O00628 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX7O00628 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX7O00628 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX7O00628 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX7O00628 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms