Protein–RNA interactions for Protein: O00458

IFRD1, Interferon-related developmental regulator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1O00458 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFRD1O00458 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFRD1O00458 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFRD1O00458 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFRD1O00458 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFRD1O00458 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFRD1O00458 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IFRD1O00458 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IFRD1O00458 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFRD1O00458 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFRD1O00458 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFRD1O00458 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFRD1O00458 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
IFRD1O00458 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFRD1O00458 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFRD1O00458 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFRD1O00458 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFRD1O00458 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFRD1O00458 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFRD1O00458 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFRD1O00458 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFRD1O00458 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
IFRD1O00458 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFRD1O00458 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFRD1O00458 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
IFRD1O00458 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFRD1O00458 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFRD1O00458 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFRD1O00458 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFRD1O00458 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFRD1O00458 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
IFRD1O00458 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFRD1O00458 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFRD1O00458 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFRD1O00458 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFRD1O00458 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFRD1O00458 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFRD1O00458 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFRD1O00458 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFRD1O00458 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFRD1O00458 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFRD1O00458 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFRD1O00458 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFRD1O00458 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IFRD1O00458 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFRD1O00458 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFRD1O00458 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFRD1O00458 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFRD1O00458 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFRD1O00458 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFRD1O00458 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFRD1O00458 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFRD1O00458 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFRD1O00458 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFRD1O00458 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
IFRD1O00458 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFRD1O00458 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFRD1O00458 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFRD1O00458 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFRD1O00458 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFRD1O00458 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFRD1O00458 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
IFRD1O00458 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IFRD1O00458 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFRD1O00458 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFRD1O00458 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFRD1O00458 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFRD1O00458 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFRD1O00458 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFRD1O00458 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFRD1O00458 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms