Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TULP1O00294 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TULP1O00294 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TULP1O00294 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TULP1O00294 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TULP1O00294 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TULP1O00294 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TULP1O00294 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TULP1O00294 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TULP1O00294 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TULP1O00294 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TULP1O00294 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TULP1O00294 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TULP1O00294 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP1O00294 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TULP1O00294 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TULP1O00294 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TULP1O00294 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TULP1O00294 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TULP1O00294 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TULP1O00294 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TULP1O00294 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TULP1O00294 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TULP1O00294 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TULP1O00294 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TULP1O00294 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TULP1O00294 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TULP1O00294 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TULP1O00294 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TULP1O00294 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TULP1O00294 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TULP1O00294 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TULP1O00294 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TULP1O00294 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TULP1O00294 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TULP1O00294 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TULP1O00294 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TULP1O00294 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TULP1O00294 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TULP1O00294 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TULP1O00294 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TULP1O00294 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TULP1O00294 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TULP1O00294 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TULP1O00294 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TULP1O00294 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TULP1O00294 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TULP1O00294 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TULP1O00294 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TULP1O00294 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TULP1O00294 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TULP1O00294 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TULP1O00294 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TULP1O00294 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TULP1O00294 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TULP1O00294 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TULP1O00294 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TULP1O00294 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TULP1O00294 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TULP1O00294 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TULP1O00294 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TULP1O00294 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TULP1O00294 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TULP1O00294 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TULP1O00294 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TULP1O00294 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TULP1O00294 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TULP1O00294 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TULP1O00294 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TULP1O00294 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TULP1O00294 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TULP1O00294 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TULP1O00294 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TULP1O00294 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TULP1O00294 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TULP1O00294 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TULP1O00294 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TULP1O00294 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TULP1O00294 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TULP1O00294 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TULP1O00294 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TULP1O00294 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TULP1O00294 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TULP1O00294 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TULP1O00294 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TULP1O00294 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TULP1O00294 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TULP1O00294 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TULP1O00294 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TULP1O00294 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TULP1O00294 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TULP1O00294 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TULP1O00294 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TULP1O00294 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TULP1O00294 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TULP1O00294 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TULP1O00294 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TULP1O00294 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP1O00294 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP1O00294 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms