Protein–RNA interactions for Protein: K9M1U5

IFNL4, Interferon lambda-4, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL4K9M1U5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNL4K9M1U5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNL4K9M1U5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNL4K9M1U5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNL4K9M1U5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL4K9M1U5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL4K9M1U5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL4K9M1U5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL4K9M1U5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL4K9M1U5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL4K9M1U5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL4K9M1U5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL4K9M1U5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL4K9M1U5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNL4K9M1U5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFNL4K9M1U5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNL4K9M1U5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNL4K9M1U5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNL4K9M1U5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNL4K9M1U5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNL4K9M1U5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNL4K9M1U5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNL4K9M1U5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNL4K9M1U5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNL4K9M1U5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNL4K9M1U5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL4K9M1U5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL4K9M1U5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNL4K9M1U5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNL4K9M1U5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNL4K9M1U5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IFNL4K9M1U5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNL4K9M1U5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNL4K9M1U5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNL4K9M1U5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNL4K9M1U5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNL4K9M1U5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNL4K9M1U5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNL4K9M1U5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNL4K9M1U5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNL4K9M1U5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNL4K9M1U5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNL4K9M1U5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNL4K9M1U5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNL4K9M1U5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNL4K9M1U5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNL4K9M1U5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNL4K9M1U5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNL4K9M1U5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNL4K9M1U5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNL4K9M1U5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL4K9M1U5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL4K9M1U5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL4K9M1U5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNL4K9M1U5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNL4K9M1U5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNL4K9M1U5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNL4K9M1U5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNL4K9M1U5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNL4K9M1U5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNL4K9M1U5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNL4K9M1U5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNL4K9M1U5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL4K9M1U5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL4K9M1U5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL4K9M1U5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL4K9M1U5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL4K9M1U5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL4K9M1U5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL4K9M1U5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNL4K9M1U5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNL4K9M1U5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL4K9M1U5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL4K9M1U5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL4K9M1U5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL4K9M1U5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL4K9M1U5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL4K9M1U5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL4K9M1U5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL4K9M1U5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL4K9M1U5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL4K9M1U5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL4K9M1U5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL4K9M1U5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL4K9M1U5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL4K9M1U5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL4K9M1U5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL4K9M1U5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL4K9M1U5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL4K9M1U5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL4K9M1U5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL4K9M1U5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL4K9M1U5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL4K9M1U5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL4K9M1U5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL4K9M1U5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL4K9M1U5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNL4K9M1U5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNL4K9M1U5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNL4K9M1U5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms