Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms