Protein–RNA interactions for Protein: H3BSH0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 61 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BSH0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BSH0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H3BSH0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BSH0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BSH0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BSH0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BSH0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BSH0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BSH0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BSH0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BSH0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BSH0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BSH0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BSH0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BSH0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BSH0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BSH0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BSH0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BSH0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BSH0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3BSH0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
H3BSH0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
H3BSH0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
H3BSH0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BSH0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BSH0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BSH0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BSH0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BSH0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BSH0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BSH0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BSH0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BSH0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BSH0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BSH0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BSH0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BSH0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BSH0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BSH0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BSH0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BSH0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BSH0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BSH0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BSH0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BSH0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BSH0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BSH0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BSH0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BSH0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BSH0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BSH0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BSH0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BSH0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BSH0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BSH0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BSH0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BSH0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BSH0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BSH0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BSH0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BSH0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BSH0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BSH0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BSH0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BSH0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H3BSH0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BSH0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BSH0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BSH0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BSH0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BSH0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BSH0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BSH0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BSH0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BSH0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BSH0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BSH0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BSH0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BSH0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BSH0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BSH0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BSH0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BSH0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BSH0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BSH0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
H3BSH0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BSH0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BSH0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BSH0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BSH0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BSH0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BSH0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BSH0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H3BSH0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H3BSH0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H3BSH0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
H3BSH0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H3BSH0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H3BSH0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H3BSH0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms