Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H3BNH8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H3BNH8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
H3BNH8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
H3BNH8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H3BNH8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H3BNH8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H3BNH8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H3BNH8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H3BNH8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H3BNH8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H3BNH8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H3BNH8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H3BNH8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BNH8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BNH8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BNH8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BNH8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BNH8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BNH8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BNH8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BNH8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
H3BNH8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BNH8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BNH8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BNH8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BNH8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BNH8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BNH8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BNH8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BNH8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BNH8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BNH8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BNH8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BNH8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BNH8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BNH8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BNH8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BNH8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BNH8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BNH8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BNH8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BNH8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BNH8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BNH8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BNH8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BNH8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BNH8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BNH8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BNH8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BNH8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BNH8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BNH8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H3BNH8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
H3BNH8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
H3BNH8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BNH8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BNH8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BNH8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BNH8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BNH8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BNH8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BNH8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BNH8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BNH8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BNH8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BNH8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BNH8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BNH8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BNH8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BNH8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BNH8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BNH8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BNH8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BNH8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BNH8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BNH8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BNH8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BNH8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BNH8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BNH8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BNH8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BNH8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BNH8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BNH8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BNH8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BNH8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BNH8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BNH8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BNH8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BNH8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BNH8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BNH8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BNH8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BNH8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BNH8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BNH8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BNH8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BNH8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BNH8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms