Protein–RNA interactions for Protein: C9J7I0

UMAD1, UBAP1-MVB12-associated (UMA)-domain containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UMAD1C9J7I0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UMAD1C9J7I0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UMAD1C9J7I0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UMAD1C9J7I0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UMAD1C9J7I0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UMAD1C9J7I0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UMAD1C9J7I0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UMAD1C9J7I0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UMAD1C9J7I0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UMAD1C9J7I0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UMAD1C9J7I0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UMAD1C9J7I0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UMAD1C9J7I0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UMAD1C9J7I0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UMAD1C9J7I0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UMAD1C9J7I0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UMAD1C9J7I0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UMAD1C9J7I0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UMAD1C9J7I0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UMAD1C9J7I0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UMAD1C9J7I0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UMAD1C9J7I0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UMAD1C9J7I0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UMAD1C9J7I0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UMAD1C9J7I0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UMAD1C9J7I0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UMAD1C9J7I0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UMAD1C9J7I0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UMAD1C9J7I0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UMAD1C9J7I0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UMAD1C9J7I0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UMAD1C9J7I0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UMAD1C9J7I0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UMAD1C9J7I0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UMAD1C9J7I0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UMAD1C9J7I0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UMAD1C9J7I0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UMAD1C9J7I0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UMAD1C9J7I0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UMAD1C9J7I0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UMAD1C9J7I0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UMAD1C9J7I0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UMAD1C9J7I0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UMAD1C9J7I0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UMAD1C9J7I0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UMAD1C9J7I0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UMAD1C9J7I0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UMAD1C9J7I0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UMAD1C9J7I0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UMAD1C9J7I0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UMAD1C9J7I0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UMAD1C9J7I0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UMAD1C9J7I0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UMAD1C9J7I0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UMAD1C9J7I0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UMAD1C9J7I0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UMAD1C9J7I0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UMAD1C9J7I0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UMAD1C9J7I0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UMAD1C9J7I0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UMAD1C9J7I0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UMAD1C9J7I0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UMAD1C9J7I0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UMAD1C9J7I0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UMAD1C9J7I0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UMAD1C9J7I0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UMAD1C9J7I0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UMAD1C9J7I0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UMAD1C9J7I0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
UMAD1C9J7I0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UMAD1C9J7I0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UMAD1C9J7I0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UMAD1C9J7I0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UMAD1C9J7I0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UMAD1C9J7I0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UMAD1C9J7I0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UMAD1C9J7I0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UMAD1C9J7I0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UMAD1C9J7I0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UMAD1C9J7I0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UMAD1C9J7I0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UMAD1C9J7I0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UMAD1C9J7I0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UMAD1C9J7I0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UMAD1C9J7I0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UMAD1C9J7I0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UMAD1C9J7I0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UMAD1C9J7I0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UMAD1C9J7I0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UMAD1C9J7I0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UMAD1C9J7I0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UMAD1C9J7I0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UMAD1C9J7I0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UMAD1C9J7I0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UMAD1C9J7I0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UMAD1C9J7I0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UMAD1C9J7I0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UMAD1C9J7I0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UMAD1C9J7I0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UMAD1C9J7I0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms