Protein–RNA interactions for Protein: B6A8C7

TARM1, T-cell-interacting, activating receptor on myeloid cells protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARM1B6A8C7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TARM1B6A8C7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TARM1B6A8C7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TARM1B6A8C7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TARM1B6A8C7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TARM1B6A8C7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TARM1B6A8C7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TARM1B6A8C7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TARM1B6A8C7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TARM1B6A8C7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TARM1B6A8C7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TARM1B6A8C7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TARM1B6A8C7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TARM1B6A8C7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TARM1B6A8C7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TARM1B6A8C7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TARM1B6A8C7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TARM1B6A8C7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TARM1B6A8C7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TARM1B6A8C7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TARM1B6A8C7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TARM1B6A8C7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TARM1B6A8C7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TARM1B6A8C7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TARM1B6A8C7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TARM1B6A8C7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TARM1B6A8C7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TARM1B6A8C7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TARM1B6A8C7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TARM1B6A8C7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TARM1B6A8C7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TARM1B6A8C7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TARM1B6A8C7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TARM1B6A8C7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TARM1B6A8C7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TARM1B6A8C7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TARM1B6A8C7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TARM1B6A8C7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TARM1B6A8C7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TARM1B6A8C7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TARM1B6A8C7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TARM1B6A8C7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TARM1B6A8C7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TARM1B6A8C7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TARM1B6A8C7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TARM1B6A8C7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TARM1B6A8C7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TARM1B6A8C7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TARM1B6A8C7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TARM1B6A8C7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TARM1B6A8C7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TARM1B6A8C7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TARM1B6A8C7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TARM1B6A8C7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TARM1B6A8C7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TARM1B6A8C7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TARM1B6A8C7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TARM1B6A8C7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TARM1B6A8C7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TARM1B6A8C7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TARM1B6A8C7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TARM1B6A8C7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TARM1B6A8C7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TARM1B6A8C7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TARM1B6A8C7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TARM1B6A8C7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TARM1B6A8C7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TARM1B6A8C7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TARM1B6A8C7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TARM1B6A8C7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TARM1B6A8C7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TARM1B6A8C7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TARM1B6A8C7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TARM1B6A8C7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TARM1B6A8C7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TARM1B6A8C7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TARM1B6A8C7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TARM1B6A8C7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TARM1B6A8C7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TARM1B6A8C7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TARM1B6A8C7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TARM1B6A8C7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TARM1B6A8C7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TARM1B6A8C7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TARM1B6A8C7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TARM1B6A8C7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TARM1B6A8C7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TARM1B6A8C7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TARM1B6A8C7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TARM1B6A8C7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TARM1B6A8C7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TARM1B6A8C7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TARM1B6A8C7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TARM1B6A8C7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TARM1B6A8C7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TARM1B6A8C7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TARM1B6A8C7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TARM1B6A8C7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TARM1B6A8C7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TARM1B6A8C7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms