Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BECN2A8MW95 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BECN2A8MW95 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BECN2A8MW95 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BECN2A8MW95 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BECN2A8MW95 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BECN2A8MW95 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BECN2A8MW95 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BECN2A8MW95 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BECN2A8MW95 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BECN2A8MW95 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BECN2A8MW95 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BECN2A8MW95 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BECN2A8MW95 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BECN2A8MW95 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BECN2A8MW95 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BECN2A8MW95 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BECN2A8MW95 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BECN2A8MW95 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BECN2A8MW95 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BECN2A8MW95 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BECN2A8MW95 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BECN2A8MW95 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BECN2A8MW95 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BECN2A8MW95 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
BECN2A8MW95 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BECN2A8MW95 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BECN2A8MW95 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BECN2A8MW95 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BECN2A8MW95 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BECN2A8MW95 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BECN2A8MW95 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BECN2A8MW95 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
BECN2A8MW95 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BECN2A8MW95 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BECN2A8MW95 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BECN2A8MW95 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BECN2A8MW95 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BECN2A8MW95 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BECN2A8MW95 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BECN2A8MW95 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BECN2A8MW95 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BECN2A8MW95 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BECN2A8MW95 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BECN2A8MW95 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BECN2A8MW95 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BECN2A8MW95 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BECN2A8MW95 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BECN2A8MW95 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BECN2A8MW95 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BECN2A8MW95 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BECN2A8MW95 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BECN2A8MW95 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BECN2A8MW95 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BECN2A8MW95 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BECN2A8MW95 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BECN2A8MW95 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BECN2A8MW95 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BECN2A8MW95 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BECN2A8MW95 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BECN2A8MW95 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BECN2A8MW95 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BECN2A8MW95 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BECN2A8MW95 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BECN2A8MW95 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BECN2A8MW95 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BECN2A8MW95 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BECN2A8MW95 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BECN2A8MW95 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BECN2A8MW95 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BECN2A8MW95 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BECN2A8MW95 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BECN2A8MW95 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BECN2A8MW95 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BECN2A8MW95 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BECN2A8MW95 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BECN2A8MW95 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BECN2A8MW95 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
BECN2A8MW95 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BECN2A8MW95 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BECN2A8MW95 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BECN2A8MW95 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BECN2A8MW95 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BECN2A8MW95 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BECN2A8MW95 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BECN2A8MW95 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BECN2A8MW95 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BECN2A8MW95 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BECN2A8MW95 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BECN2A8MW95 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BECN2A8MW95 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BECN2A8MW95 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BECN2A8MW95 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BECN2A8MW95 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BECN2A8MW95 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BECN2A8MW95 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BECN2A8MW95 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BECN2A8MW95 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BECN2A8MW95 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BECN2A8MW95 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms