Protein–RNA interactions for Protein: A6NI03

TRIM64B, Putative tripartite motif-containing protein 64B, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM64BA6NI03 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM64BA6NI03 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM64BA6NI03 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM64BA6NI03 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM64BA6NI03 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM64BA6NI03 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM64BA6NI03 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM64BA6NI03 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM64BA6NI03 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM64BA6NI03 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM64BA6NI03 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM64BA6NI03 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM64BA6NI03 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM64BA6NI03 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM64BA6NI03 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM64BA6NI03 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM64BA6NI03 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM64BA6NI03 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM64BA6NI03 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM64BA6NI03 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM64BA6NI03 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM64BA6NI03 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM64BA6NI03 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM64BA6NI03 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM64BA6NI03 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM64BA6NI03 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM64BA6NI03 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM64BA6NI03 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM64BA6NI03 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM64BA6NI03 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM64BA6NI03 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM64BA6NI03 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM64BA6NI03 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM64BA6NI03 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM64BA6NI03 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM64BA6NI03 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM64BA6NI03 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM64BA6NI03 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM64BA6NI03 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM64BA6NI03 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM64BA6NI03 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM64BA6NI03 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM64BA6NI03 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM64BA6NI03 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM64BA6NI03 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM64BA6NI03 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM64BA6NI03 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM64BA6NI03 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM64BA6NI03 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM64BA6NI03 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM64BA6NI03 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM64BA6NI03 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM64BA6NI03 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM64BA6NI03 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM64BA6NI03 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM64BA6NI03 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM64BA6NI03 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM64BA6NI03 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM64BA6NI03 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM64BA6NI03 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM64BA6NI03 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM64BA6NI03 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM64BA6NI03 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM64BA6NI03 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM64BA6NI03 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM64BA6NI03 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM64BA6NI03 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM64BA6NI03 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM64BA6NI03 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM64BA6NI03 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM64BA6NI03 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM64BA6NI03 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM64BA6NI03 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM64BA6NI03 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM64BA6NI03 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM64BA6NI03 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM64BA6NI03 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM64BA6NI03 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM64BA6NI03 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM64BA6NI03 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM64BA6NI03 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM64BA6NI03 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM64BA6NI03 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM64BA6NI03 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM64BA6NI03 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM64BA6NI03 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM64BA6NI03 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM64BA6NI03 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM64BA6NI03 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM64BA6NI03 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM64BA6NI03 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM64BA6NI03 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM64BA6NI03 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM64BA6NI03 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM64BA6NI03 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM64BA6NI03 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM64BA6NI03 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM64BA6NI03 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM64BA6NI03 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM64BA6NI03 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms