Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00862A6NCI5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00862A6NCI5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00862A6NCI5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00862A6NCI5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00862A6NCI5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00862A6NCI5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00862A6NCI5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00862A6NCI5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00862A6NCI5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00862A6NCI5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00862A6NCI5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00862A6NCI5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00862A6NCI5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00862A6NCI5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00862A6NCI5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00862A6NCI5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00862A6NCI5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00862A6NCI5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00862A6NCI5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00862A6NCI5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00862A6NCI5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00862A6NCI5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00862A6NCI5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00862A6NCI5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00862A6NCI5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00862A6NCI5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00862A6NCI5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00862A6NCI5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00862A6NCI5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00862A6NCI5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00862A6NCI5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00862A6NCI5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00862A6NCI5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00862A6NCI5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00862A6NCI5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00862A6NCI5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00862A6NCI5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00862A6NCI5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00862A6NCI5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00862A6NCI5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00862A6NCI5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00862A6NCI5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00862A6NCI5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00862A6NCI5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00862A6NCI5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00862A6NCI5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00862A6NCI5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00862A6NCI5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00862A6NCI5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00862A6NCI5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00862A6NCI5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00862A6NCI5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00862A6NCI5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00862A6NCI5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00862A6NCI5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00862A6NCI5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00862A6NCI5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00862A6NCI5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00862A6NCI5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00862A6NCI5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00862A6NCI5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00862A6NCI5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00862A6NCI5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00862A6NCI5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00862A6NCI5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00862A6NCI5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00862A6NCI5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00862A6NCI5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC00862A6NCI5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00862A6NCI5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00862A6NCI5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00862A6NCI5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00862A6NCI5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00862A6NCI5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00862A6NCI5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms