Protein–RNA interactions for Protein: A0AVI4

TMEM129, E3 ubiquitin-protein ligase TM129, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM129A0AVI4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM129A0AVI4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM129A0AVI4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM129A0AVI4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM129A0AVI4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM129A0AVI4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM129A0AVI4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM129A0AVI4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM129A0AVI4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM129A0AVI4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM129A0AVI4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM129A0AVI4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM129A0AVI4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM129A0AVI4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM129A0AVI4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM129A0AVI4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM129A0AVI4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM129A0AVI4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM129A0AVI4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM129A0AVI4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM129A0AVI4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM129A0AVI4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM129A0AVI4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM129A0AVI4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM129A0AVI4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM129A0AVI4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM129A0AVI4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM129A0AVI4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM129A0AVI4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM129A0AVI4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM129A0AVI4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM129A0AVI4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM129A0AVI4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM129A0AVI4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM129A0AVI4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM129A0AVI4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM129A0AVI4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM129A0AVI4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM129A0AVI4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM129A0AVI4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM129A0AVI4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM129A0AVI4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM129A0AVI4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM129A0AVI4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM129A0AVI4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM129A0AVI4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM129A0AVI4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM129A0AVI4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM129A0AVI4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM129A0AVI4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM129A0AVI4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM129A0AVI4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM129A0AVI4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM129A0AVI4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM129A0AVI4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM129A0AVI4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM129A0AVI4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM129A0AVI4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM129A0AVI4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM129A0AVI4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM129A0AVI4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM129A0AVI4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM129A0AVI4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM129A0AVI4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM129A0AVI4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM129A0AVI4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM129A0AVI4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM129A0AVI4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM129A0AVI4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM129A0AVI4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM129A0AVI4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM129A0AVI4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM129A0AVI4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM129A0AVI4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM129A0AVI4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM129A0AVI4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms