Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GUH1

Aminomethyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GUH1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1B0GUH1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1B0GUH1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1B0GUH1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1B0GUH1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1B0GUH1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1B0GUH1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1B0GUH1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1B0GUH1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1B0GUH1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1B0GUH1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1B0GUH1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1B0GUH1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1B0GUH1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1B0GUH1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1B0GUH1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1B0GUH1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1B0GUH1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1B0GUH1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1B0GUH1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1B0GUH1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1B0GUH1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1B0GUH1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1B0GUH1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1B0GUH1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1B0GUH1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1B0GUH1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1B0GUH1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1B0GUH1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1B0GUH1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1B0GUH1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1B0GUH1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1B0GUH1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1B0GUH1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1B0GUH1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1B0GUH1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1B0GUH1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1B0GUH1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1B0GUH1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1B0GUH1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1B0GUH1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1B0GUH1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A1B0GUH1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1B0GUH1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GUH1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GUH1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GUH1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GUH1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1B0GUH1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1B0GUH1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1B0GUH1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1B0GUH1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A1B0GUH1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A1B0GUH1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1B0GUH1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1B0GUH1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1B0GUH1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1B0GUH1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1B0GUH1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1B0GUH1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1B0GUH1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1B0GUH1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1B0GUH1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1B0GUH1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1B0GUH1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1B0GUH1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1B0GUH1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1B0GUH1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1B0GUH1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GUH1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GUH1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GUH1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GUH1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GUH1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GUH1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GUH1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GUH1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GUH1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GUH1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GUH1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GUH1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1B0GUH1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1B0GUH1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1B0GUH1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1B0GUH1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1B0GUH1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1B0GUH1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1B0GUH1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1B0GUH1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1B0GUH1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1B0GUH1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1B0GUH1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1B0GUH1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
A0A1B0GUH1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1B0GUH1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1B0GUH1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1B0GUH1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1B0GUH1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1B0GUH1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A1B0GUH1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms