Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRBV2A0A0J9YWF9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRBV2A0A0J9YWF9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRBV2A0A0J9YWF9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRBV2A0A0J9YWF9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRBV2A0A0J9YWF9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRBV2A0A0J9YWF9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRBV2A0A0J9YWF9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRBV2A0A0J9YWF9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRBV2A0A0J9YWF9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRBV2A0A0J9YWF9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRBV2A0A0J9YWF9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRBV2A0A0J9YWF9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRBV2A0A0J9YWF9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRBV2A0A0J9YWF9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRBV2A0A0J9YWF9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRBV2A0A0J9YWF9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRBV2A0A0J9YWF9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRBV2A0A0J9YWF9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRBV2A0A0J9YWF9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRBV2A0A0J9YWF9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRBV2A0A0J9YWF9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRBV2A0A0J9YWF9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRBV2A0A0J9YWF9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRBV2A0A0J9YWF9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRBV2A0A0J9YWF9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRBV2A0A0J9YWF9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRBV2A0A0J9YWF9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRBV2A0A0J9YWF9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRBV2A0A0J9YWF9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRBV2A0A0J9YWF9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRBV2A0A0J9YWF9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRBV2A0A0J9YWF9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRBV2A0A0J9YWF9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRBV2A0A0J9YWF9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRBV2A0A0J9YWF9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRBV2A0A0J9YWF9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRBV2A0A0J9YWF9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRBV2A0A0J9YWF9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRBV2A0A0J9YWF9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRBV2A0A0J9YWF9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRBV2A0A0J9YWF9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRBV2A0A0J9YWF9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRBV2A0A0J9YWF9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBV2A0A0J9YWF9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBV2A0A0J9YWF9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBV2A0A0J9YWF9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBV2A0A0J9YWF9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRBV2A0A0J9YWF9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRBV2A0A0J9YWF9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRBV2A0A0J9YWF9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRBV2A0A0J9YWF9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRBV2A0A0J9YWF9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRBV2A0A0J9YWF9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRBV2A0A0J9YWF9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRBV2A0A0J9YWF9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRBV2A0A0J9YWF9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRBV2A0A0J9YWF9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRBV2A0A0J9YWF9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRBV2A0A0J9YWF9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRBV2A0A0J9YWF9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRBV2A0A0J9YWF9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRBV2A0A0J9YWF9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRBV2A0A0J9YWF9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRBV2A0A0J9YWF9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRBV2A0A0J9YWF9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBV2A0A0J9YWF9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBV2A0A0J9YWF9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBV2A0A0J9YWF9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBV2A0A0J9YWF9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRBV2A0A0J9YWF9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRBV2A0A0J9YWF9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRBV2A0A0J9YWF9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRBV2A0A0J9YWF9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRBV2A0A0J9YWF9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRBV2A0A0J9YWF9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRBV2A0A0J9YWF9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRBV2A0A0J9YWF9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV2A0A0J9YWF9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV2A0A0J9YWF9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV2A0A0J9YWF9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRBV2A0A0J9YWF9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRBV2A0A0J9YWF9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRBV2A0A0J9YWF9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRBV2A0A0J9YWF9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRBV2A0A0J9YWF9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRBV2A0A0J9YWF9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRBV2A0A0J9YWF9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRBV2A0A0J9YWF9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRBV2A0A0J9YWF9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRBV2A0A0J9YWF9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRBV2A0A0J9YWF9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRBV2A0A0J9YWF9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms