Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J293

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J293 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0B4J293 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0B4J293 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
A0A0B4J293 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0B4J293 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0B4J293 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0B4J293 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0B4J293 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0B4J293 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0B4J293 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0B4J293 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0B4J293 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0B4J293 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0B4J293 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0B4J293 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0B4J293 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0B4J293 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0B4J293 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0B4J293 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0B4J293 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0B4J293 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
A0A0B4J293 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0B4J293 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0B4J293 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0B4J293 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0B4J293 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0B4J293 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0B4J293 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0B4J293 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0B4J293 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0B4J293 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0B4J293 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0B4J293 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0B4J293 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0B4J293 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0B4J293 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0B4J293 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0B4J293 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0B4J293 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0B4J293 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0B4J293 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0B4J293 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0B4J293 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0B4J293 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0B4J293 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0B4J293 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0B4J293 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0B4J293 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0B4J293 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0B4J293 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0B4J293 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0B4J293 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0B4J293 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0B4J293 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0B4J293 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A0B4J293 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J293 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J293 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J293 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0B4J293 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J293 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J293 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J293 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J293 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0B4J293 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0B4J293 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0B4J293 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0B4J293 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0B4J293 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0B4J293 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J293 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J293 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J293 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0B4J293 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0B4J293 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0B4J293 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0B4J293 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0B4J293 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0B4J293 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0B4J293 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J293 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J293 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J293 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J293 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J293 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J293 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J293 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J293 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J293 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0B4J293 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0B4J293 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0B4J293 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0B4J293 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0B4J293 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0B4J293 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0B4J293 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0B4J293 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0B4J293 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0B4J293 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0B4J293 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms