Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N3

TRBV24-1, T-cell receptor beta variable 24-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV24-1A0A075B6N3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRBV24-1A0A075B6N3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRBV24-1A0A075B6N3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRBV24-1A0A075B6N3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRBV24-1A0A075B6N3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRBV24-1A0A075B6N3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRBV24-1A0A075B6N3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRBV24-1A0A075B6N3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV24-1A0A075B6N3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV24-1A0A075B6N3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV24-1A0A075B6N3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV24-1A0A075B6N3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV24-1A0A075B6N3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRBV24-1A0A075B6N3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRBV24-1A0A075B6N3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRBV24-1A0A075B6N3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRBV24-1A0A075B6N3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRBV24-1A0A075B6N3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRBV24-1A0A075B6N3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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TRBV24-1A0A075B6N3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRBV24-1A0A075B6N3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRBV24-1A0A075B6N3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRBV24-1A0A075B6N3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV24-1A0A075B6N3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRBV24-1A0A075B6N3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRBV24-1A0A075B6N3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRBV24-1A0A075B6N3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRBV24-1A0A075B6N3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRBV24-1A0A075B6N3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRBV24-1A0A075B6N3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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TRBV24-1A0A075B6N3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TRBV24-1A0A075B6N3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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TRBV24-1A0A075B6N3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRBV24-1A0A075B6N3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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TRBV24-1A0A075B6N3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRBV24-1A0A075B6N3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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TRBV24-1A0A075B6N3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRBV24-1A0A075B6N3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRBV24-1A0A075B6N3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRBV24-1A0A075B6N3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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TRBV24-1A0A075B6N3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRBV24-1A0A075B6N3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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TRBV24-1A0A075B6N3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRBV24-1A0A075B6N3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRBV24-1A0A075B6N3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRBV24-1A0A075B6N3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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TRBV24-1A0A075B6N3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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TRBV24-1A0A075B6N3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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TRBV24-1A0A075B6N3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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TRBV24-1A0A075B6N3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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TRBV24-1A0A075B6N3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV24-1A0A075B6N3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV24-1A0A075B6N3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRBV24-1A0A075B6N3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRBV24-1A0A075B6N3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRBV24-1A0A075B6N3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV24-1A0A075B6N3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV24-1A0A075B6N3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV24-1A0A075B6N3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV24-1A0A075B6N3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRBV24-1A0A075B6N3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRBV24-1A0A075B6N3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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TRBV24-1A0A075B6N3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRBV24-1A0A075B6N3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRBV24-1A0A075B6N3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRBV24-1A0A075B6N3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRBV24-1A0A075B6N3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRBV24-1A0A075B6N3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV24-1A0A075B6N3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV24-1A0A075B6N3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV24-1A0A075B6N3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV24-1A0A075B6N3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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