Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 TCP1-218ENST00000546204 566 ntTSL 27.78□□□□□ -1.164e-16■■■■■ 39.6
SF3B4Q15427 C3-212ENST00000599899 1992 ntTSL 28.64□□□□□ -1.035e-11■■■■■ 39.6
SF3B4Q15427 CLMN-205ENST00000556416 1772 ntTSL 220.77■□□□□ 0.917e-15■■■■■ 39.6
SF3B4Q15427 CLMN-208ENST00000557215 515 ntTSL 38.73□□□□□ -1.017e-15■■■■■ 39.6
SF3B4Q15427 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.637e-15■■■■■ 39.6
SF3B4Q15427 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.421e-7■■■■■ 39.6
SF3B4Q15427 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 39.6
SF3B4Q15427 RAP1GAP-213ENST00000611549 4294 ntTSL 512.16□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 39.6
SF3B4Q15427 RAP1GAP-201ENST00000290101 3584 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 39.6
SF3B4Q15427 RAP1GAP-209ENST00000471600 3238 ntTSL 511.29□□□□□ -0.61e-7■■■■■ 39.6
SF3B4Q15427 RAP1GAP-206ENST00000374765 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 39.6
SF3B4Q15427 RAP1GAP-212ENST00000542643 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 39.6
SF3B4Q15427 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.477e-9■■■■■ 39.6
SF3B4Q15427 CPNE1-209ENST00000415920 731 ntTSL 512.13□□□□□ -0.474e-8■■■■■ 39.6
SF3B4Q15427 DPAGT1-212ENST00000525456 1020 ntTSL 512.26□□□□□ -0.457e-11■■■■■ 39.6
SF3B4Q15427 DPAGT1-218ENST00000640102 1195 ntTSL 510.88□□□□□ -0.677e-11■■■■■ 39.6
SF3B4Q15427 DPAGT1-211ENST00000524658 437 ntTSL 37.68□□□□□ -1.187e-11■■■■■ 39.6
SF3B4Q15427 RABGGTB-206ENST00000467748 468 ntTSL 34.21□□□□□ -1.742e-9■■■■■ 39.5
SF3B4Q15427 KIAA0100-215ENST00000583403 1271 ntTSL 1 (best)20.4■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 39.5
SF3B4Q15427 RAD9A-206ENST00000541132 586 ntTSL 316.51■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 39.5
SF3B4Q15427 RAD9A-207ENST00000542139 578 ntTSL 414.02□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 39.5
SF3B4Q15427 RAD9A-208ENST00000543808 822 ntTSL 514□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 39.5
SF3B4Q15427 ILF3-205ENST00000586544 3859 ntTSL 1 (best)10.32□□□□□ -0.763e-11■■■■■ 39.5
SF3B4Q15427 SLC19A1-203ENST00000417954 3572 ntTSL 1 (best)14.66□□□□□ -0.062e-8■■■■■ 39.5
SF3B4Q15427 FAM193B-202ENST00000504130 394 ntTSL 512.84□□□□□ -0.353e-11■■■■■ 39.5
SF3B4Q15427 FAM193B-207ENST00000506879 580 ntTSL 211□□□□□ -0.653e-11■■■■■ 39.5
SF3B4Q15427 DDX5-214ENST00000580026 1171 ntTSL 29.25□□□□□ -0.934e-9■■■■■ 39.5
SF3B4Q15427 DDX5-216ENST00000581237 592 ntTSL 56.45□□□□□ -1.384e-9■■■■■ 39.5
SF3B4Q15427 NOP14-205ENST00000507120 703 ntTSL 313.88□□□□□ -0.191e-10■■■■■ 39.5
SF3B4Q15427 LRBA-208ENST00000510157 1636 ntTSL 512.84□□□□□ -0.354e-8■■■■■ 39.5
SF3B4Q15427 LRBA-213ENST00000515096 2914 ntTSL 1 (best)7.06□□□□□ -1.284e-8■■■■■ 39.5
SF3B4Q15427 LRBA-203ENST00000503716 3712 ntTSL 1 (best)6.29□□□□□ -1.44e-8■■■■■ 39.5
SF3B4Q15427 ORC2-205ENST00000467605 568 ntTSL 38.2□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 39.4
SF3B4Q15427 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.227e-19■■■■■ 39.4
SF3B4Q15427 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.638e-19■■■■■ 39.4
SF3B4Q15427 MED24-231ENST00000584782 542 ntTSL 38.55□□□□□ -1.045e-7■■■■■ 39.4
SF3B4Q15427 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 39.4
SF3B4Q15427 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.243e-7■■■■■ 39.4
SF3B4Q15427 TEX22-202ENST00000548638 508 ntTSL 510.83□□□□□ -0.682e-12■■■■■ 39.4
SF3B4Q15427 LARP1-213ENST00000523163 843 ntTSL 57.16□□□□□ -1.265e-11■■■■■ 39.4
SF3B4Q15427 COASY-213ENST00000591753 2225 ntTSL 1 (best)16.72■□□□□ 0.275e-8■■■■■ 39.4
SF3B4Q15427 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.45e-8■■■■■ 39.4
SF3B4Q15427 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.495e-8■■■■■ 39.4
SF3B4Q15427 COASY-201ENST00000393818 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.645e-8■■■■■ 39.4
SF3B4Q15427 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.533e-7■■■■■ 39.3
SF3B4Q15427 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.523e-7■■■■■ 39.3
SF3B4Q15427 DGCR8-207ENST00000491892 630 ntTSL 214.55□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 39.3
SF3B4Q15427 HDAC4-214ENST00000535493 2743 ntTSL 213.19□□□□□ -0.33e-7■■■■■ 39.3
SF3B4Q15427 HDAC4-208ENST00000463007 3158 ntTSL 1 (best)12.2□□□□□ -0.463e-7■■■■■ 39.3
SF3B4Q15427 HDAC4-210ENST00000493582 3188 ntTSL 1 (best)11.91□□□□□ -0.53e-7■■■■■ 39.3
SF3B4Q15427 DCAF12-201ENST00000361264 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.773e-7■■■■■ 39.3
SF3B4Q15427 DCAF12-202ENST00000396990 803 ntTSL 39.39□□□□□ -0.913e-7■■■■■ 39.3
SF3B4Q15427 DCAF12-204ENST00000463286 682 ntTSL 38.28□□□□□ -1.083e-7■■■■■ 39.3
SF3B4Q15427 DCAF12-203ENST00000450964 676 ntTSL 58.1□□□□□ -1.113e-7■■■■■ 39.3
SF3B4Q15427 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.168e-7■■■■■ 39.3
SF3B4Q15427 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.418e-7■■■■■ 39.3
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SF3B4Q15427 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.228e-7■■■■■ 39.3
SF3B4Q15427 GLB1L2-202ENST00000529077 5621 ntTSL 1 (best)13.1□□□□□ -0.318e-7■■■■■ 39.3
SF3B4Q15427 ANKRD11-202ENST00000330736 8342 ntTSL 513.16□□□□□ -0.37e-8■■■■■ 39.3
SF3B4Q15427 CLCN7-206ENST00000563822 851 ntTSL 513.47□□□□□ -0.255e-19■■■■■ 39.3
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SF3B4Q15427 ACSM3-213ENST00000568235 558 ntTSL 411.07□□□□□ -0.643e-10■■■■■ 39.3
SF3B4Q15427 LIG3-213ENST00000590630 904 ntTSL 510.8□□□□□ -0.682e-10■■■■■ 39.3
SF3B4Q15427 RPS21-203ENST00000370592 401 ntTSL 211.02□□□□□ -0.656e-13■■■■■ 39.3
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SF3B4Q15427 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 13e-9■■■■■ 39.3
SF3B4Q15427 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.393e-9■■■■■ 39.3
SF3B4Q15427 MAP2K2-208ENST00000599345 923 ntTSL 518.53■□□□□ 0.567e-8■■■■■ 39.3
SF3B4Q15427 MAP2K2-205ENST00000597008 866 ntTSL 29.31□□□□□ -0.927e-8■■■■■ 39.3
SF3B4Q15427 CCNL2-215ENST00000482621 2059 ntTSL 214.16□□□□□ -0.141e-8■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 CSNK1D-219ENST00000581660 611 ntTSL 512.73□□□□□ -0.372e-13■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 CSNK1D-207ENST00000578194 567 ntTSL 411.54□□□□□ -0.562e-13■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.548e-25■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 ZFC3H1-207ENST00000549407 852 ntTSL 316.78■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.261e-7■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 DENND5A-216ENST00000533737 743 ntTSL 312.6□□□□□ -0.396e-9■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 DENND5A-208ENST00000528725 728 ntTSL 310.02□□□□□ -0.816e-9■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 ZFC3H1-208ENST00000550712 571 ntTSL 44.93□□□□□ -1.621e-7■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.417e-7■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 SLC25A10-207ENST00000574129 1523 ntTSL 527.82■■■□□ 2.041e-7■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.751e-7■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.021e-7■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 STARD13-209ENST00000567873 2037 ntTSL 1 (best)17.35■□□□□ 0.379e-12■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 AGAP3-224ENST00000494808 487 ntTSL 212.12□□□□□ -0.479e-12■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.579e-12■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 STARD13-201ENST00000255486 5798 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.589e-12■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 STARD13-204ENST00000399365 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.589e-12■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 N4BP2L2-212ENST00000505213 2343 ntTSL 59.94□□□□□ -0.823e-10■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 N4BP2L2-214ENST00000511143 816 ntTSL 37.26□□□□□ -1.253e-10■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.473e-10■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 N4BP2L2-207ENST00000475731 444 ntTSL 54.56□□□□□ -1.683e-10■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.73e-10■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.823e-10■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.923e-10■■■■■ 39.2
SF3B4Q15427 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -23e-10■■■■■ 39.2
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