RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556416.1

CLMN-205, Transcript of calmin, humanhuman

TSL 2

Gene CLMN, Length 1,772 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMN-205ENST00000556416 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.66■■■■■ 6.34
CLMN-205ENST00000556416 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.09■■■■■ 5.29
CLMN-205ENST00000556416 ABCC9O60706 1549 aa45.87■■■■■ 4.93
CLMN-205ENST00000556416 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.81■■■■■ 4.92
CLMN-205ENST00000556416 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.23■■■■■ 4.83
CLMN-205ENST00000556416 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.17■■■■■ 4.82
CLMN-205ENST00000556416 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.93■■■■■ 4.78
CLMN-205ENST00000556416 NACADO15069 1562 aa44.85■■■■■ 4.77
CLMN-205ENST00000556416 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.62■■■■■ 4.73
CLMN-205ENST00000556416 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.05■■■■■ 4.64
CLMN-205ENST00000556416 SCRIBQ14160 1630 aa44.05■■■■■ 4.64
CLMN-205ENST00000556416 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.8■■■■■ 4.6
CLMN-205ENST00000556416 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.29■■■■■ 4.52
CLMN-205ENST00000556416 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.05■■■■■ 4.48
CLMN-205ENST00000556416 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.48■■■■■ 4.39
CLMN-205ENST00000556416 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.28■■■■■ 4.36
CLMN-205ENST00000556416 SMARCA4P51532 1647 aa42.2■■■■■ 4.35
CLMN-205ENST00000556416 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.2■■■■■ 4.35
CLMN-205ENST00000556416 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.12■■■■■ 4.33
CLMN-205ENST00000556416 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
CLMN-205ENST00000556416 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
CLMN-205ENST00000556416 WIZO95785 1651 aa41.87■■■■■ 4.29
CLMN-205ENST00000556416 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.71■■■■■ 4.27
CLMN-205ENST00000556416 SMARCA2P51531 1590 aa41.61■■■■■ 4.25
CLMN-205ENST00000556416 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.59■■■■■ 4.25
CLMN-205ENST00000556416 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.56■■■■■ 4.24
CLMN-205ENST00000556416 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
CLMN-205ENST00000556416 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
CLMN-205ENST00000556416 NCAPD3P42695 1498 aa41.33■■■■■ 4.21
CLMN-205ENST00000556416 HMGXB3Q12766 1538 aa41.3■■■■■ 4.2
CLMN-205ENST00000556416 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.92■■■■■ 4.14
CLMN-205ENST00000556416 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.91■■■■■ 4.14
CLMN-205ENST00000556416 CFTRP13569 1480 aa40.25■■■■■ 4.03
CLMN-205ENST00000556416 PRDM2Q13029 1718 aa40.21■■■■■ 4.03
CLMN-205ENST00000556416 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.2■■■■■ 4.03
CLMN-205ENST00000556416 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.11■■■■■ 4.01
CLMN-205ENST00000556416 NESP48681 1621 aa40.08■■■■■ 4.01
CLMN-205ENST00000556416 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.92■■■■□ 3.98
CLMN-205ENST00000556416 ABCC8Q09428 1581 aa39.89■■■■□ 3.98
CLMN-205ENST00000556416 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.79■■■■□ 3.96
CLMN-205ENST00000556416 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.73■■■■□ 3.95
CLMN-205ENST00000556416 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.71■■■■□ 3.95
CLMN-205ENST00000556416 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.67■■■■□ 3.94
CLMN-205ENST00000556416 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.63■■■■□ 3.94
CLMN-205ENST00000556416 SYNJ1O43426 1573 aa39.6■■■■□ 3.93
CLMN-205ENST00000556416 TRIM41Q8WV44 630 aa39.58■■■■□ 3.93
CLMN-205ENST00000556416 CUX1P39880 1505 aa39.51■■■■□ 3.92
CLMN-205ENST00000556416 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.51■■■■□ 3.92
CLMN-205ENST00000556416 TOP2BQ02880 1626 aa39.5■■■■□ 3.91
CLMN-205ENST00000556416 ERCC6Q03468 1493 aa39.4■■■■□ 3.9
CLMN-205ENST00000556416 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.38■■■■□ 3.9
CLMN-205ENST00000556416 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
CLMN-205ENST00000556416 TOPBP1Q92547 1522 aa39.32■■■■□ 3.88
CLMN-205ENST00000556416 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.3■■■■□ 3.88
CLMN-205ENST00000556416 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
CLMN-205ENST00000556416 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.17■■■■□ 3.86
CLMN-205ENST00000556416 WDR62O43379 1518 aa39.15■■■■□ 3.86
CLMN-205ENST00000556416 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.07■■■■□ 3.84
CLMN-205ENST00000556416 SOGA1O94964 1423 aa38.95■■■■□ 3.83
CLMN-205ENST00000556416 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.9■■■■□ 3.82
CLMN-205ENST00000556416 WDR97A6NE52 1622 aa38.85■■■■□ 3.81
CLMN-205ENST00000556416 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.85■■■■□ 3.81
CLMN-205ENST00000556416 CUX2O14529 1486 aa38.83■■■■□ 3.81
CLMN-205ENST00000556416 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.83■■■■□ 3.81
CLMN-205ENST00000556416 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.82■■■■□ 3.8
CLMN-205ENST00000556416 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.81■■■■□ 3.8
CLMN-205ENST00000556416 EEA1Q15075 1411 aa38.79■■■■□ 3.8
CLMN-205ENST00000556416 KIF27Q86VH2 1401 aa38.72■■■■□ 3.79
CLMN-205ENST00000556416 IFT140Q96RY7 1462 aa38.71■■■■□ 3.79
CLMN-205ENST00000556416 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.61■■■■□ 3.77
CLMN-205ENST00000556416 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.56■■■■□ 3.76
CLMN-205ENST00000556416 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.55■■■■□ 3.76
CLMN-205ENST00000556416 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.5■■■■□ 3.75
CLMN-205ENST00000556416 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.48■■■■□ 3.75
CLMN-205ENST00000556416 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.45■■■■□ 3.75
CLMN-205ENST00000556416 PBRM1Q86U86 1689 aa38.44■■■■□ 3.74
CLMN-205ENST00000556416 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.42■■■■□ 3.74
CLMN-205ENST00000556416 IGF1RP08069 1367 aa38.4■■■■□ 3.74
CLMN-205ENST00000556416 KIF21BO75037 1637 aa38.39■■■■□ 3.74
CLMN-205ENST00000556416 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.37■■■■□ 3.73
CLMN-205ENST00000556416 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.34■■■■□ 3.73
CLMN-205ENST00000556416 CUL7Q14999 1698 aa38.32■■■■□ 3.72
CLMN-205ENST00000556416 PRXQ9BXM0 1461 aa38.31■■■■□ 3.72
CLMN-205ENST00000556416 GRIN2BQ13224 1484 aa38.29■■■■□ 3.72
CLMN-205ENST00000556416 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.27■■■■□ 3.72
CLMN-205ENST00000556416 GOLGA3Q08378 1498 aa38.24■■■■□ 3.71
CLMN-205ENST00000556416 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.21■■■■□ 3.71
CLMN-205ENST00000556416 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.21■■■■□ 3.71
CLMN-205ENST00000556416 ADAMTS12P58397 1594 aa38.15■■■■□ 3.7
CLMN-205ENST00000556416 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.11■■■■□ 3.69
CLMN-205ENST00000556416 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.06■■■■□ 3.68
CLMN-205ENST00000556416 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.05■■■■□ 3.68
CLMN-205ENST00000556416 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38■■■■□ 3.67
CLMN-205ENST00000556416 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.95■■■■□ 3.67
CLMN-205ENST00000556416 SYNJ2O15056 1496 aa37.9■■■■□ 3.66
CLMN-205ENST00000556416 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.84■■■■□ 3.65
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CLMN-205ENST00000556416 CHD1O14646 1710 aa37.78■■■■□ 3.64
CLMN-205ENST00000556416 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
CLMN-205ENST00000556416 CEP162Q5TB80 1403 aa37.72■■■■□ 3.63
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