Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y624

F11R, Junctional adhesion molecule A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11RQ9Y624 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
F11RQ9Y624 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
F11RQ9Y624 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
F11RQ9Y624 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
F11RQ9Y624 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
F11RQ9Y624 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
F11RQ9Y624 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
F11RQ9Y624 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
F11RQ9Y624 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
F11RQ9Y624 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
F11RQ9Y624 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
F11RQ9Y624 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
F11RQ9Y624 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
F11RQ9Y624 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
F11RQ9Y624 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
F11RQ9Y624 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
F11RQ9Y624 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
F11RQ9Y624 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
F11RQ9Y624 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F11RQ9Y624 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F11RQ9Y624 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F11RQ9Y624 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
F11RQ9Y624 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
F11RQ9Y624 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F11RQ9Y624 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F11RQ9Y624 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F11RQ9Y624 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F11RQ9Y624 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F11RQ9Y624 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F11RQ9Y624 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F11RQ9Y624 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F11RQ9Y624 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F11RQ9Y624 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
F11RQ9Y624 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
F11RQ9Y624 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
F11RQ9Y624 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F11RQ9Y624 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
F11RQ9Y624 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
F11RQ9Y624 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
F11RQ9Y624 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
F11RQ9Y624 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
F11RQ9Y624 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
F11RQ9Y624 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
F11RQ9Y624 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
F11RQ9Y624 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
F11RQ9Y624 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
F11RQ9Y624 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
F11RQ9Y624 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
F11RQ9Y624 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
F11RQ9Y624 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
F11RQ9Y624 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
F11RQ9Y624 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
F11RQ9Y624 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
F11RQ9Y624 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
F11RQ9Y624 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
F11RQ9Y624 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
F11RQ9Y624 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
F11RQ9Y624 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
F11RQ9Y624 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
F11RQ9Y624 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
F11RQ9Y624 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
F11RQ9Y624 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
F11RQ9Y624 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
F11RQ9Y624 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
F11RQ9Y624 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
F11RQ9Y624 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
F11RQ9Y624 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
F11RQ9Y624 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
F11RQ9Y624 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
F11RQ9Y624 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
F11RQ9Y624 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
F11RQ9Y624 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
F11RQ9Y624 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
F11RQ9Y624 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F11RQ9Y624 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
F11RQ9Y624 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F11RQ9Y624 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
F11RQ9Y624 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
F11RQ9Y624 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F11RQ9Y624 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F11RQ9Y624 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F11RQ9Y624 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
F11RQ9Y624 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
F11RQ9Y624 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
F11RQ9Y624 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
F11RQ9Y624 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
F11RQ9Y624 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
F11RQ9Y624 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
F11RQ9Y624 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
F11RQ9Y624 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
F11RQ9Y624 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
F11RQ9Y624 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
F11RQ9Y624 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
F11RQ9Y624 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
F11RQ9Y624 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
F11RQ9Y624 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
F11RQ9Y624 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
F11RQ9Y624 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
F11RQ9Y624 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
F11RQ9Y624 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms