Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G0

PCDHGB5, Protocadherin gamma-B5, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB5Q9Y5G0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHGB5Q9Y5G0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHGB5Q9Y5G0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDHGB5Q9Y5G0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDHGB5Q9Y5G0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHGB5Q9Y5G0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHGB5Q9Y5G0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHGB5Q9Y5G0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHGB5Q9Y5G0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHGB5Q9Y5G0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHGB5Q9Y5G0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHGB5Q9Y5G0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHGB5Q9Y5G0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHGB5Q9Y5G0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHGB5Q9Y5G0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHGB5Q9Y5G0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHGB5Q9Y5G0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHGB5Q9Y5G0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHGB5Q9Y5G0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHGB5Q9Y5G0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHGB5Q9Y5G0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHGB5Q9Y5G0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHGB5Q9Y5G0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHGB5Q9Y5G0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHGB5Q9Y5G0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHGB5Q9Y5G0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHGB5Q9Y5G0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHGB5Q9Y5G0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHGB5Q9Y5G0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHGB5Q9Y5G0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHGB5Q9Y5G0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHGB5Q9Y5G0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHGB5Q9Y5G0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHGB5Q9Y5G0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHGB5Q9Y5G0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHGB5Q9Y5G0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHGB5Q9Y5G0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHGB5Q9Y5G0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHGB5Q9Y5G0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHGB5Q9Y5G0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHGB5Q9Y5G0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHGB5Q9Y5G0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHGB5Q9Y5G0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHGB5Q9Y5G0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHGB5Q9Y5G0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCDHGB5Q9Y5G0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCDHGB5Q9Y5G0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCDHGB5Q9Y5G0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHGB5Q9Y5G0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHGB5Q9Y5G0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHGB5Q9Y5G0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHGB5Q9Y5G0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHGB5Q9Y5G0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHGB5Q9Y5G0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHGB5Q9Y5G0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHGB5Q9Y5G0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHGB5Q9Y5G0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHGB5Q9Y5G0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHGB5Q9Y5G0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHGB5Q9Y5G0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHGB5Q9Y5G0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHGB5Q9Y5G0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHGB5Q9Y5G0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHGB5Q9Y5G0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHGB5Q9Y5G0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHGB5Q9Y5G0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHGB5Q9Y5G0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHGB5Q9Y5G0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHGB5Q9Y5G0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHGB5Q9Y5G0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHGB5Q9Y5G0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHGB5Q9Y5G0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHGB5Q9Y5G0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHGB5Q9Y5G0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHGB5Q9Y5G0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHGB5Q9Y5G0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHGB5Q9Y5G0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHGB5Q9Y5G0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHGB5Q9Y5G0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHGB5Q9Y5G0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHGB5Q9Y5G0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHGB5Q9Y5G0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHGB5Q9Y5G0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHGB5Q9Y5G0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHGB5Q9Y5G0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHGB5Q9Y5G0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHGB5Q9Y5G0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PCDHGB5Q9Y5G0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHGB5Q9Y5G0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHGB5Q9Y5G0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHGB5Q9Y5G0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHGB5Q9Y5G0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHGB5Q9Y5G0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHGB5Q9Y5G0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHGB5Q9Y5G0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHGB5Q9Y5G0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHGB5Q9Y5G0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHGB5Q9Y5G0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms