Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5C1

ANGPTL3, Angiopoietin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANGPTL3Q9Y5C1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ANGPTL3Q9Y5C1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ANGPTL3Q9Y5C1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ANGPTL3Q9Y5C1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ANGPTL3Q9Y5C1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ANGPTL3Q9Y5C1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ANGPTL3Q9Y5C1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ANGPTL3Q9Y5C1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ANGPTL3Q9Y5C1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ANGPTL3Q9Y5C1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ANGPTL3Q9Y5C1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ANGPTL3Q9Y5C1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANGPTL3Q9Y5C1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ANGPTL3Q9Y5C1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ANGPTL3Q9Y5C1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ANGPTL3Q9Y5C1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ANGPTL3Q9Y5C1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANGPTL3Q9Y5C1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANGPTL3Q9Y5C1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ANGPTL3Q9Y5C1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ANGPTL3Q9Y5C1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ANGPTL3Q9Y5C1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ANGPTL3Q9Y5C1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANGPTL3Q9Y5C1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ANGPTL3Q9Y5C1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANGPTL3Q9Y5C1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANGPTL3Q9Y5C1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANGPTL3Q9Y5C1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ANGPTL3Q9Y5C1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANGPTL3Q9Y5C1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ANGPTL3Q9Y5C1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ANGPTL3Q9Y5C1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ANGPTL3Q9Y5C1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ANGPTL3Q9Y5C1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ANGPTL3Q9Y5C1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ANGPTL3Q9Y5C1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ANGPTL3Q9Y5C1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ANGPTL3Q9Y5C1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ANGPTL3Q9Y5C1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ANGPTL3Q9Y5C1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ANGPTL3Q9Y5C1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ANGPTL3Q9Y5C1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ANGPTL3Q9Y5C1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ANGPTL3Q9Y5C1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ANGPTL3Q9Y5C1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ANGPTL3Q9Y5C1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ANGPTL3Q9Y5C1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ANGPTL3Q9Y5C1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ANGPTL3Q9Y5C1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ANGPTL3Q9Y5C1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ANGPTL3Q9Y5C1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ANGPTL3Q9Y5C1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ANGPTL3Q9Y5C1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ANGPTL3Q9Y5C1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ANGPTL3Q9Y5C1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ANGPTL3Q9Y5C1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ANGPTL3Q9Y5C1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ANGPTL3Q9Y5C1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ANGPTL3Q9Y5C1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ANGPTL3Q9Y5C1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ANGPTL3Q9Y5C1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ANGPTL3Q9Y5C1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ANGPTL3Q9Y5C1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ANGPTL3Q9Y5C1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ANGPTL3Q9Y5C1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ANGPTL3Q9Y5C1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ANGPTL3Q9Y5C1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ANGPTL3Q9Y5C1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ANGPTL3Q9Y5C1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ANGPTL3Q9Y5C1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ANGPTL3Q9Y5C1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ANGPTL3Q9Y5C1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ANGPTL3Q9Y5C1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ANGPTL3Q9Y5C1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ANGPTL3Q9Y5C1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ANGPTL3Q9Y5C1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ANGPTL3Q9Y5C1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ANGPTL3Q9Y5C1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ANGPTL3Q9Y5C1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ANGPTL3Q9Y5C1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ANGPTL3Q9Y5C1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ANGPTL3Q9Y5C1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ANGPTL3Q9Y5C1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ANGPTL3Q9Y5C1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ANGPTL3Q9Y5C1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ANGPTL3Q9Y5C1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ANGPTL3Q9Y5C1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ANGPTL3Q9Y5C1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ANGPTL3Q9Y5C1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ANGPTL3Q9Y5C1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ANGPTL3Q9Y5C1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ANGPTL3Q9Y5C1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ANGPTL3Q9Y5C1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ANGPTL3Q9Y5C1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ANGPTL3Q9Y5C1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ANGPTL3Q9Y5C1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ANGPTL3Q9Y5C1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ANGPTL3Q9Y5C1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ANGPTL3Q9Y5C1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ANGPTL3Q9Y5C1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms