Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
RAPGEF2Q9Y4G8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
RAPGEF2Q9Y4G8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
RAPGEF2Q9Y4G8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC45.1■■■■■ 4.81
RAPGEF2Q9Y4G8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC45.08■■■■■ 4.81
RAPGEF2Q9Y4G8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC45.07■■■■■ 4.81
RAPGEF2Q9Y4G8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
RAPGEF2Q9Y4G8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
RAPGEF2Q9Y4G8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
RAPGEF2Q9Y4G8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.02■■■■■ 4.8
RAPGEF2Q9Y4G8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
RAPGEF2Q9Y4G8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
RAPGEF2Q9Y4G8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.93■■■■■ 4.78
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.93■■■■■ 4.78
RAPGEF2Q9Y4G8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
RAPGEF2Q9Y4G8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
RAPGEF2Q9Y4G8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
RAPGEF2Q9Y4G8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
RAPGEF2Q9Y4G8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC44.9■■■■■ 4.78
RAPGEF2Q9Y4G8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
RAPGEF2Q9Y4G8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC44.86■■■■■ 4.77
RAPGEF2Q9Y4G8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
RAPGEF2Q9Y4G8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
RAPGEF2Q9Y4G8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
RAPGEF2Q9Y4G8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
RAPGEF2Q9Y4G8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
RAPGEF2Q9Y4G8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC44.78■■■■■ 4.76
RAPGEF2Q9Y4G8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
RAPGEF2Q9Y4G8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
RAPGEF2Q9Y4G8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC44.76■■■■■ 4.76
RAPGEF2Q9Y4G8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC44.76■■■■■ 4.76
RAPGEF2Q9Y4G8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
RAPGEF2Q9Y4G8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
RAPGEF2Q9Y4G8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC44.75■■■■■ 4.75
RAPGEF2Q9Y4G8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
RAPGEF2Q9Y4G8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
RAPGEF2Q9Y4G8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC44.73■■■■■ 4.75
RAPGEF2Q9Y4G8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC44.73■■■■■ 4.75
RAPGEF2Q9Y4G8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
RAPGEF2Q9Y4G8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
RAPGEF2Q9Y4G8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
RAPGEF2Q9Y4G8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
RAPGEF2Q9Y4G8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
RAPGEF2Q9Y4G8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
RAPGEF2Q9Y4G8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
RAPGEF2Q9Y4G8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC44.68■■■■■ 4.74
RAPGEF2Q9Y4G8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
RAPGEF2Q9Y4G8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
RAPGEF2Q9Y4G8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
RAPGEF2Q9Y4G8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
RAPGEF2Q9Y4G8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
RAPGEF2Q9Y4G8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
RAPGEF2Q9Y4G8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC44.62■■■■■ 4.73
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC44.61■■■■■ 4.73
RAPGEF2Q9Y4G8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
RAPGEF2Q9Y4G8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
RAPGEF2Q9Y4G8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
RAPGEF2Q9Y4G8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
RAPGEF2Q9Y4G8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
RAPGEF2Q9Y4G8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC44.59■■■■■ 4.73
RAPGEF2Q9Y4G8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC44.59■■■■■ 4.73
RAPGEF2Q9Y4G8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
RAPGEF2Q9Y4G8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
RAPGEF2Q9Y4G8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC44.58■■■■■ 4.73
RAPGEF2Q9Y4G8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
RAPGEF2Q9Y4G8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.72
RAPGEF2Q9Y4G8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.57■■■■■ 4.72
RAPGEF2Q9Y4G8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
RAPGEF2Q9Y4G8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC44.56■■■■■ 4.72
RAPGEF2Q9Y4G8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
RAPGEF2Q9Y4G8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
RAPGEF2Q9Y4G8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
RAPGEF2Q9Y4G8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
RAPGEF2Q9Y4G8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
RAPGEF2Q9Y4G8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC44.52■■■■■ 4.72
RAPGEF2Q9Y4G8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
RAPGEF2Q9Y4G8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
RAPGEF2Q9Y4G8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
RAPGEF2Q9Y4G8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
RAPGEF2Q9Y4G8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
RAPGEF2Q9Y4G8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
RAPGEF2Q9Y4G8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
RAPGEF2Q9Y4G8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
RAPGEF2Q9Y4G8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
RAPGEF2Q9Y4G8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC44.39■■■■■ 4.7
RAPGEF2Q9Y4G8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
RAPGEF2Q9Y4G8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
RAPGEF2Q9Y4G8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC44.37■■■■■ 4.69
RAPGEF2Q9Y4G8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.36■■■■■ 4.69
RAPGEF2Q9Y4G8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC44.36■■■■■ 4.69
RAPGEF2Q9Y4G8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
RAPGEF2Q9Y4G8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
RAPGEF2Q9Y4G8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
RAPGEF2Q9Y4G8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
RAPGEF2Q9Y4G8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
RAPGEF2Q9Y4G8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
RAPGEF2Q9Y4G8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms