Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FAN1Q9Y2M0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FAN1Q9Y2M0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
FAN1Q9Y2M0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FAN1Q9Y2M0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FAN1Q9Y2M0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
FAN1Q9Y2M0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FAN1Q9Y2M0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FAN1Q9Y2M0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FAN1Q9Y2M0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FAN1Q9Y2M0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FAN1Q9Y2M0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FAN1Q9Y2M0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
FAN1Q9Y2M0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
FAN1Q9Y2M0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FAN1Q9Y2M0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FAN1Q9Y2M0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FAN1Q9Y2M0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FAN1Q9Y2M0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FAN1Q9Y2M0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FAN1Q9Y2M0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FAN1Q9Y2M0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FAN1Q9Y2M0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FAN1Q9Y2M0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FAN1Q9Y2M0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FAN1Q9Y2M0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FAN1Q9Y2M0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FAN1Q9Y2M0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FAN1Q9Y2M0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FAN1Q9Y2M0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FAN1Q9Y2M0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FAN1Q9Y2M0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FAN1Q9Y2M0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FAN1Q9Y2M0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FAN1Q9Y2M0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
FAN1Q9Y2M0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FAN1Q9Y2M0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FAN1Q9Y2M0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FAN1Q9Y2M0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FAN1Q9Y2M0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FAN1Q9Y2M0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FAN1Q9Y2M0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FAN1Q9Y2M0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FAN1Q9Y2M0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FAN1Q9Y2M0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FAN1Q9Y2M0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FAN1Q9Y2M0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FAN1Q9Y2M0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
FAN1Q9Y2M0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FAN1Q9Y2M0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FAN1Q9Y2M0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FAN1Q9Y2M0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FAN1Q9Y2M0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FAN1Q9Y2M0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FAN1Q9Y2M0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
FAN1Q9Y2M0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FAN1Q9Y2M0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FAN1Q9Y2M0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FAN1Q9Y2M0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FAN1Q9Y2M0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FAN1Q9Y2M0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FAN1Q9Y2M0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FAN1Q9Y2M0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FAN1Q9Y2M0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
FAN1Q9Y2M0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FAN1Q9Y2M0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
FAN1Q9Y2M0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FAN1Q9Y2M0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FAN1Q9Y2M0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FAN1Q9Y2M0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FAN1Q9Y2M0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FAN1Q9Y2M0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FAN1Q9Y2M0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FAN1Q9Y2M0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FAN1Q9Y2M0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FAN1Q9Y2M0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FAN1Q9Y2M0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FAN1Q9Y2M0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FAN1Q9Y2M0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FAN1Q9Y2M0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FAN1Q9Y2M0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FAN1Q9Y2M0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
FAN1Q9Y2M0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FAN1Q9Y2M0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FAN1Q9Y2M0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FAN1Q9Y2M0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FAN1Q9Y2M0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FAN1Q9Y2M0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
FAN1Q9Y2M0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FAN1Q9Y2M0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FAN1Q9Y2M0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FAN1Q9Y2M0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FAN1Q9Y2M0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FAN1Q9Y2M0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FAN1Q9Y2M0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FAN1Q9Y2M0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FAN1Q9Y2M0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FAN1Q9Y2M0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FAN1Q9Y2M0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
FAN1Q9Y2M0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms