Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y287

ITM2B, Integral membrane protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2BQ9Y287 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITM2BQ9Y287 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITM2BQ9Y287 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITM2BQ9Y287 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ITM2BQ9Y287 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITM2BQ9Y287 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITM2BQ9Y287 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITM2BQ9Y287 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITM2BQ9Y287 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITM2BQ9Y287 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ITM2BQ9Y287 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITM2BQ9Y287 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ITM2BQ9Y287 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITM2BQ9Y287 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITM2BQ9Y287 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITM2BQ9Y287 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITM2BQ9Y287 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITM2BQ9Y287 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITM2BQ9Y287 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITM2BQ9Y287 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITM2BQ9Y287 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITM2BQ9Y287 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITM2BQ9Y287 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ITM2BQ9Y287 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITM2BQ9Y287 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ITM2BQ9Y287 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ITM2BQ9Y287 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITM2BQ9Y287 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITM2BQ9Y287 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITM2BQ9Y287 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITM2BQ9Y287 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITM2BQ9Y287 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITM2BQ9Y287 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITM2BQ9Y287 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITM2BQ9Y287 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITM2BQ9Y287 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITM2BQ9Y287 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITM2BQ9Y287 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITM2BQ9Y287 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ITM2BQ9Y287 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ITM2BQ9Y287 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITM2BQ9Y287 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITM2BQ9Y287 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ITM2BQ9Y287 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITM2BQ9Y287 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITM2BQ9Y287 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITM2BQ9Y287 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITM2BQ9Y287 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ITM2BQ9Y287 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITM2BQ9Y287 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITM2BQ9Y287 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ITM2BQ9Y287 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITM2BQ9Y287 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITM2BQ9Y287 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITM2BQ9Y287 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITM2BQ9Y287 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITM2BQ9Y287 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITM2BQ9Y287 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITM2BQ9Y287 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITM2BQ9Y287 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITM2BQ9Y287 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITM2BQ9Y287 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITM2BQ9Y287 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITM2BQ9Y287 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITM2BQ9Y287 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ITM2BQ9Y287 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITM2BQ9Y287 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITM2BQ9Y287 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITM2BQ9Y287 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITM2BQ9Y287 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITM2BQ9Y287 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITM2BQ9Y287 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITM2BQ9Y287 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITM2BQ9Y287 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITM2BQ9Y287 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITM2BQ9Y287 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITM2BQ9Y287 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITM2BQ9Y287 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITM2BQ9Y287 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITM2BQ9Y287 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITM2BQ9Y287 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITM2BQ9Y287 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITM2BQ9Y287 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITM2BQ9Y287 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITM2BQ9Y287 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITM2BQ9Y287 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITM2BQ9Y287 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITM2BQ9Y287 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITM2BQ9Y287 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITM2BQ9Y287 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITM2BQ9Y287 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITM2BQ9Y287 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITM2BQ9Y287 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITM2BQ9Y287 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITM2BQ9Y287 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ITM2BQ9Y287 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITM2BQ9Y287 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITM2BQ9Y287 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITM2BQ9Y287 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ITM2BQ9Y287 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.4 ms