Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRPC6Q9Y210 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRPC6Q9Y210 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TRPC6Q9Y210 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
TRPC6Q9Y210 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRPC6Q9Y210 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRPC6Q9Y210 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
TRPC6Q9Y210 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRPC6Q9Y210 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRPC6Q9Y210 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRPC6Q9Y210 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRPC6Q9Y210 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRPC6Q9Y210 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRPC6Q9Y210 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRPC6Q9Y210 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
TRPC6Q9Y210 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRPC6Q9Y210 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRPC6Q9Y210 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRPC6Q9Y210 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TRPC6Q9Y210 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
TRPC6Q9Y210 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRPC6Q9Y210 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRPC6Q9Y210 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRPC6Q9Y210 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRPC6Q9Y210 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRPC6Q9Y210 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRPC6Q9Y210 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRPC6Q9Y210 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRPC6Q9Y210 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRPC6Q9Y210 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRPC6Q9Y210 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
TRPC6Q9Y210 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRPC6Q9Y210 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRPC6Q9Y210 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRPC6Q9Y210 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRPC6Q9Y210 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRPC6Q9Y210 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRPC6Q9Y210 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRPC6Q9Y210 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRPC6Q9Y210 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRPC6Q9Y210 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRPC6Q9Y210 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRPC6Q9Y210 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRPC6Q9Y210 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRPC6Q9Y210 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRPC6Q9Y210 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRPC6Q9Y210 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRPC6Q9Y210 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRPC6Q9Y210 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRPC6Q9Y210 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TRPC6Q9Y210 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRPC6Q9Y210 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRPC6Q9Y210 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRPC6Q9Y210 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRPC6Q9Y210 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRPC6Q9Y210 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRPC6Q9Y210 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRPC6Q9Y210 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRPC6Q9Y210 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRPC6Q9Y210 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRPC6Q9Y210 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRPC6Q9Y210 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRPC6Q9Y210 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRPC6Q9Y210 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRPC6Q9Y210 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRPC6Q9Y210 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRPC6Q9Y210 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRPC6Q9Y210 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRPC6Q9Y210 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRPC6Q9Y210 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRPC6Q9Y210 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRPC6Q9Y210 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TRPC6Q9Y210 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRPC6Q9Y210 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRPC6Q9Y210 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRPC6Q9Y210 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRPC6Q9Y210 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TRPC6Q9Y210 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRPC6Q9Y210 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRPC6Q9Y210 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRPC6Q9Y210 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRPC6Q9Y210 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRPC6Q9Y210 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRPC6Q9Y210 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRPC6Q9Y210 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRPC6Q9Y210 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TRPC6Q9Y210 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRPC6Q9Y210 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRPC6Q9Y210 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRPC6Q9Y210 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRPC6Q9Y210 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRPC6Q9Y210 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRPC6Q9Y210 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRPC6Q9Y210 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRPC6Q9Y210 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRPC6Q9Y210 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRPC6Q9Y210 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRPC6Q9Y210 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRPC6Q9Y210 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRPC6Q9Y210 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms