Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHTF1Q9UMS5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PHTF1Q9UMS5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHTF1Q9UMS5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHTF1Q9UMS5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHTF1Q9UMS5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHTF1Q9UMS5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHTF1Q9UMS5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHTF1Q9UMS5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHTF1Q9UMS5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHTF1Q9UMS5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHTF1Q9UMS5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHTF1Q9UMS5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHTF1Q9UMS5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHTF1Q9UMS5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHTF1Q9UMS5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHTF1Q9UMS5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHTF1Q9UMS5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PHTF1Q9UMS5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHTF1Q9UMS5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHTF1Q9UMS5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PHTF1Q9UMS5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHTF1Q9UMS5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHTF1Q9UMS5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PHTF1Q9UMS5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHTF1Q9UMS5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHTF1Q9UMS5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PHTF1Q9UMS5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHTF1Q9UMS5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHTF1Q9UMS5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHTF1Q9UMS5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHTF1Q9UMS5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHTF1Q9UMS5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHTF1Q9UMS5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PHTF1Q9UMS5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PHTF1Q9UMS5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHTF1Q9UMS5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHTF1Q9UMS5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHTF1Q9UMS5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PHTF1Q9UMS5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHTF1Q9UMS5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHTF1Q9UMS5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHTF1Q9UMS5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHTF1Q9UMS5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PHTF1Q9UMS5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHTF1Q9UMS5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHTF1Q9UMS5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PHTF1Q9UMS5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PHTF1Q9UMS5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHTF1Q9UMS5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PHTF1Q9UMS5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHTF1Q9UMS5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHTF1Q9UMS5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PHTF1Q9UMS5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PHTF1Q9UMS5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PHTF1Q9UMS5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHTF1Q9UMS5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHTF1Q9UMS5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHTF1Q9UMS5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHTF1Q9UMS5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PHTF1Q9UMS5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PHTF1Q9UMS5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHTF1Q9UMS5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHTF1Q9UMS5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHTF1Q9UMS5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHTF1Q9UMS5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHTF1Q9UMS5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHTF1Q9UMS5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHTF1Q9UMS5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHTF1Q9UMS5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHTF1Q9UMS5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHTF1Q9UMS5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHTF1Q9UMS5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHTF1Q9UMS5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHTF1Q9UMS5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PHTF1Q9UMS5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PHTF1Q9UMS5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHTF1Q9UMS5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHTF1Q9UMS5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHTF1Q9UMS5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHTF1Q9UMS5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PHTF1Q9UMS5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHTF1Q9UMS5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHTF1Q9UMS5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHTF1Q9UMS5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHTF1Q9UMS5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHTF1Q9UMS5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHTF1Q9UMS5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHTF1Q9UMS5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHTF1Q9UMS5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHTF1Q9UMS5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PHTF1Q9UMS5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHTF1Q9UMS5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHTF1Q9UMS5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHTF1Q9UMS5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PHTF1Q9UMS5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHTF1Q9UMS5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHTF1Q9UMS5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHTF1Q9UMS5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHTF1Q9UMS5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms