Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNMA8BQ9ULN7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PNMA8BQ9ULN7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PNMA8BQ9ULN7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PNMA8BQ9ULN7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA8BQ9ULN7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA8BQ9ULN7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA8BQ9ULN7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA8BQ9ULN7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PNMA8BQ9ULN7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PNMA8BQ9ULN7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNMA8BQ9ULN7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNMA8BQ9ULN7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNMA8BQ9ULN7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PNMA8BQ9ULN7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA8BQ9ULN7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA8BQ9ULN7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA8BQ9ULN7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNMA8BQ9ULN7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNMA8BQ9ULN7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNMA8BQ9ULN7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA8BQ9ULN7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA8BQ9ULN7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA8BQ9ULN7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA8BQ9ULN7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNMA8BQ9ULN7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNMA8BQ9ULN7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PNMA8BQ9ULN7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA8BQ9ULN7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA8BQ9ULN7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA8BQ9ULN7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA8BQ9ULN7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA8BQ9ULN7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA8BQ9ULN7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA8BQ9ULN7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA8BQ9ULN7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA8BQ9ULN7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA8BQ9ULN7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA8BQ9ULN7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA8BQ9ULN7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNMA8BQ9ULN7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNMA8BQ9ULN7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNMA8BQ9ULN7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNMA8BQ9ULN7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNMA8BQ9ULN7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNMA8BQ9ULN7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNMA8BQ9ULN7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PNMA8BQ9ULN7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PNMA8BQ9ULN7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PNMA8BQ9ULN7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNMA8BQ9ULN7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNMA8BQ9ULN7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNMA8BQ9ULN7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNMA8BQ9ULN7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNMA8BQ9ULN7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PNMA8BQ9ULN7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PNMA8BQ9ULN7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PNMA8BQ9ULN7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PNMA8BQ9ULN7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PNMA8BQ9ULN7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PNMA8BQ9ULN7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PNMA8BQ9ULN7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNMA8BQ9ULN7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PNMA8BQ9ULN7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PNMA8BQ9ULN7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PNMA8BQ9ULN7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PNMA8BQ9ULN7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PNMA8BQ9ULN7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PNMA8BQ9ULN7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNMA8BQ9ULN7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNMA8BQ9ULN7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNMA8BQ9ULN7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PNMA8BQ9ULN7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNMA8BQ9ULN7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNMA8BQ9ULN7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PNMA8BQ9ULN7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PNMA8BQ9ULN7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PNMA8BQ9ULN7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PNMA8BQ9ULN7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNMA8BQ9ULN7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNMA8BQ9ULN7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PNMA8BQ9ULN7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNMA8BQ9ULN7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNMA8BQ9ULN7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA8BQ9ULN7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA8BQ9ULN7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA8BQ9ULN7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA8BQ9ULN7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA8BQ9ULN7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA8BQ9ULN7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA8BQ9ULN7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA8BQ9ULN7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA8BQ9ULN7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA8BQ9ULN7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA8BQ9ULN7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNMA8BQ9ULN7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNMA8BQ9ULN7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNMA8BQ9ULN7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA8BQ9ULN7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA8BQ9ULN7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms