Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SARDHQ9UL12 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SARDHQ9UL12 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SARDHQ9UL12 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SARDHQ9UL12 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SARDHQ9UL12 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SARDHQ9UL12 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SARDHQ9UL12 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SARDHQ9UL12 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SARDHQ9UL12 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SARDHQ9UL12 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SARDHQ9UL12 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SARDHQ9UL12 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SARDHQ9UL12 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SARDHQ9UL12 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SARDHQ9UL12 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SARDHQ9UL12 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SARDHQ9UL12 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SARDHQ9UL12 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SARDHQ9UL12 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SARDHQ9UL12 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SARDHQ9UL12 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SARDHQ9UL12 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SARDHQ9UL12 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SARDHQ9UL12 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SARDHQ9UL12 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SARDHQ9UL12 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SARDHQ9UL12 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SARDHQ9UL12 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SARDHQ9UL12 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SARDHQ9UL12 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SARDHQ9UL12 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SARDHQ9UL12 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SARDHQ9UL12 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SARDHQ9UL12 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SARDHQ9UL12 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SARDHQ9UL12 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SARDHQ9UL12 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SARDHQ9UL12 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SARDHQ9UL12 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SARDHQ9UL12 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SARDHQ9UL12 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SARDHQ9UL12 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SARDHQ9UL12 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SARDHQ9UL12 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SARDHQ9UL12 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SARDHQ9UL12 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SARDHQ9UL12 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SARDHQ9UL12 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SARDHQ9UL12 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SARDHQ9UL12 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SARDHQ9UL12 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SARDHQ9UL12 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SARDHQ9UL12 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SARDHQ9UL12 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SARDHQ9UL12 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SARDHQ9UL12 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SARDHQ9UL12 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SARDHQ9UL12 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SARDHQ9UL12 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SARDHQ9UL12 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SARDHQ9UL12 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SARDHQ9UL12 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SARDHQ9UL12 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SARDHQ9UL12 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SARDHQ9UL12 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SARDHQ9UL12 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SARDHQ9UL12 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SARDHQ9UL12 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SARDHQ9UL12 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SARDHQ9UL12 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SARDHQ9UL12 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SARDHQ9UL12 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SARDHQ9UL12 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SARDHQ9UL12 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SARDHQ9UL12 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SARDHQ9UL12 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SARDHQ9UL12 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SARDHQ9UL12 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SARDHQ9UL12 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SARDHQ9UL12 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SARDHQ9UL12 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SARDHQ9UL12 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SARDHQ9UL12 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SARDHQ9UL12 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SARDHQ9UL12 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SARDHQ9UL12 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SARDHQ9UL12 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SARDHQ9UL12 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SARDHQ9UL12 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SARDHQ9UL12 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SARDHQ9UL12 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SARDHQ9UL12 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SARDHQ9UL12 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SARDHQ9UL12 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SARDHQ9UL12 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SARDHQ9UL12 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SARDHQ9UL12 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SARDHQ9UL12 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SARDHQ9UL12 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms