Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD1

GMEB2, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMEB2Q9UKD1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
GMEB2Q9UKD1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GMEB2Q9UKD1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GMEB2Q9UKD1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GMEB2Q9UKD1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GMEB2Q9UKD1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GMEB2Q9UKD1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GMEB2Q9UKD1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GMEB2Q9UKD1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GMEB2Q9UKD1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GMEB2Q9UKD1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GMEB2Q9UKD1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GMEB2Q9UKD1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GMEB2Q9UKD1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GMEB2Q9UKD1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GMEB2Q9UKD1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GMEB2Q9UKD1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GMEB2Q9UKD1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GMEB2Q9UKD1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GMEB2Q9UKD1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GMEB2Q9UKD1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GMEB2Q9UKD1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GMEB2Q9UKD1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GMEB2Q9UKD1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GMEB2Q9UKD1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GMEB2Q9UKD1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GMEB2Q9UKD1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GMEB2Q9UKD1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GMEB2Q9UKD1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GMEB2Q9UKD1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GMEB2Q9UKD1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GMEB2Q9UKD1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GMEB2Q9UKD1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GMEB2Q9UKD1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GMEB2Q9UKD1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GMEB2Q9UKD1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GMEB2Q9UKD1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GMEB2Q9UKD1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GMEB2Q9UKD1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GMEB2Q9UKD1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GMEB2Q9UKD1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GMEB2Q9UKD1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GMEB2Q9UKD1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GMEB2Q9UKD1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GMEB2Q9UKD1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GMEB2Q9UKD1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GMEB2Q9UKD1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GMEB2Q9UKD1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GMEB2Q9UKD1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GMEB2Q9UKD1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GMEB2Q9UKD1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GMEB2Q9UKD1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GMEB2Q9UKD1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GMEB2Q9UKD1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GMEB2Q9UKD1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GMEB2Q9UKD1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GMEB2Q9UKD1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GMEB2Q9UKD1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GMEB2Q9UKD1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GMEB2Q9UKD1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GMEB2Q9UKD1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GMEB2Q9UKD1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GMEB2Q9UKD1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GMEB2Q9UKD1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GMEB2Q9UKD1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GMEB2Q9UKD1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GMEB2Q9UKD1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GMEB2Q9UKD1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GMEB2Q9UKD1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GMEB2Q9UKD1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GMEB2Q9UKD1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GMEB2Q9UKD1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GMEB2Q9UKD1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GMEB2Q9UKD1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GMEB2Q9UKD1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GMEB2Q9UKD1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GMEB2Q9UKD1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GMEB2Q9UKD1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GMEB2Q9UKD1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GMEB2Q9UKD1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GMEB2Q9UKD1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GMEB2Q9UKD1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GMEB2Q9UKD1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GMEB2Q9UKD1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GMEB2Q9UKD1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GMEB2Q9UKD1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GMEB2Q9UKD1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GMEB2Q9UKD1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GMEB2Q9UKD1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GMEB2Q9UKD1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GMEB2Q9UKD1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GMEB2Q9UKD1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GMEB2Q9UKD1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GMEB2Q9UKD1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GMEB2Q9UKD1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GMEB2Q9UKD1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GMEB2Q9UKD1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GMEB2Q9UKD1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GMEB2Q9UKD1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GMEB2Q9UKD1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms