Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGI0

ZRANB1, Ubiquitin thioesterase ZRANB1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZRANB1Q9UGI0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ZRANB1Q9UGI0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
ZRANB1Q9UGI0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ZRANB1Q9UGI0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ZRANB1Q9UGI0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
ZRANB1Q9UGI0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ZRANB1Q9UGI0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ZRANB1Q9UGI0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ZRANB1Q9UGI0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ZRANB1Q9UGI0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ZRANB1Q9UGI0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ZRANB1Q9UGI0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
ZRANB1Q9UGI0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
ZRANB1Q9UGI0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
ZRANB1Q9UGI0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
ZRANB1Q9UGI0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
ZRANB1Q9UGI0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
ZRANB1Q9UGI0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
ZRANB1Q9UGI0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ZRANB1Q9UGI0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ZRANB1Q9UGI0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ZRANB1Q9UGI0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
ZRANB1Q9UGI0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
ZRANB1Q9UGI0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
ZRANB1Q9UGI0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
ZRANB1Q9UGI0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ZRANB1Q9UGI0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ZRANB1Q9UGI0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ZRANB1Q9UGI0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ZRANB1Q9UGI0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ZRANB1Q9UGI0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ZRANB1Q9UGI0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ZRANB1Q9UGI0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ZRANB1Q9UGI0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ZRANB1Q9UGI0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ZRANB1Q9UGI0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ZRANB1Q9UGI0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ZRANB1Q9UGI0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ZRANB1Q9UGI0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ZRANB1Q9UGI0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ZRANB1Q9UGI0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ZRANB1Q9UGI0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ZRANB1Q9UGI0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ZRANB1Q9UGI0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ZRANB1Q9UGI0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
ZRANB1Q9UGI0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ZRANB1Q9UGI0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ZRANB1Q9UGI0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ZRANB1Q9UGI0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ZRANB1Q9UGI0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ZRANB1Q9UGI0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ZRANB1Q9UGI0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ZRANB1Q9UGI0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
ZRANB1Q9UGI0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ZRANB1Q9UGI0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ZRANB1Q9UGI0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ZRANB1Q9UGI0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ZRANB1Q9UGI0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ZRANB1Q9UGI0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
ZRANB1Q9UGI0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ZRANB1Q9UGI0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ZRANB1Q9UGI0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ZRANB1Q9UGI0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ZRANB1Q9UGI0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
ZRANB1Q9UGI0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ZRANB1Q9UGI0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ZRANB1Q9UGI0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ZRANB1Q9UGI0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
ZRANB1Q9UGI0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
ZRANB1Q9UGI0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ZRANB1Q9UGI0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ZRANB1Q9UGI0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ZRANB1Q9UGI0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ZRANB1Q9UGI0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ZRANB1Q9UGI0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ZRANB1Q9UGI0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ZRANB1Q9UGI0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ZRANB1Q9UGI0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ZRANB1Q9UGI0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ZRANB1Q9UGI0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ZRANB1Q9UGI0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ZRANB1Q9UGI0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ZRANB1Q9UGI0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ZRANB1Q9UGI0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ZRANB1Q9UGI0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ZRANB1Q9UGI0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ZRANB1Q9UGI0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ZRANB1Q9UGI0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ZRANB1Q9UGI0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ZRANB1Q9UGI0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ZRANB1Q9UGI0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ZRANB1Q9UGI0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ZRANB1Q9UGI0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ZRANB1Q9UGI0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ZRANB1Q9UGI0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ZRANB1Q9UGI0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ZRANB1Q9UGI0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ZRANB1Q9UGI0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ZRANB1Q9UGI0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ZRANB1Q9UGI0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms