Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK2Q9UBU2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK2Q9UBU2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK2Q9UBU2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK2Q9UBU2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK2Q9UBU2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK2Q9UBU2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK2Q9UBU2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK2Q9UBU2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK2Q9UBU2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DKK2Q9UBU2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DKK2Q9UBU2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DKK2Q9UBU2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DKK2Q9UBU2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DKK2Q9UBU2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DKK2Q9UBU2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DKK2Q9UBU2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DKK2Q9UBU2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DKK2Q9UBU2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DKK2Q9UBU2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DKK2Q9UBU2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DKK2Q9UBU2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DKK2Q9UBU2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DKK2Q9UBU2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DKK2Q9UBU2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DKK2Q9UBU2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DKK2Q9UBU2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DKK2Q9UBU2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DKK2Q9UBU2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DKK2Q9UBU2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DKK2Q9UBU2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DKK2Q9UBU2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DKK2Q9UBU2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DKK2Q9UBU2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DKK2Q9UBU2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DKK2Q9UBU2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DKK2Q9UBU2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DKK2Q9UBU2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
DKK2Q9UBU2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DKK2Q9UBU2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DKK2Q9UBU2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DKK2Q9UBU2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DKK2Q9UBU2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DKK2Q9UBU2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DKK2Q9UBU2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DKK2Q9UBU2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DKK2Q9UBU2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DKK2Q9UBU2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DKK2Q9UBU2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DKK2Q9UBU2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DKK2Q9UBU2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DKK2Q9UBU2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DKK2Q9UBU2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DKK2Q9UBU2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DKK2Q9UBU2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DKK2Q9UBU2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DKK2Q9UBU2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DKK2Q9UBU2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DKK2Q9UBU2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DKK2Q9UBU2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DKK2Q9UBU2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
DKK2Q9UBU2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DKK2Q9UBU2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DKK2Q9UBU2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DKK2Q9UBU2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DKK2Q9UBU2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DKK2Q9UBU2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DKK2Q9UBU2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DKK2Q9UBU2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DKK2Q9UBU2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DKK2Q9UBU2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DKK2Q9UBU2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DKK2Q9UBU2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DKK2Q9UBU2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DKK2Q9UBU2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DKK2Q9UBU2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DKK2Q9UBU2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
DKK2Q9UBU2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DKK2Q9UBU2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DKK2Q9UBU2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DKK2Q9UBU2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DKK2Q9UBU2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DKK2Q9UBU2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DKK2Q9UBU2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DKK2Q9UBU2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DKK2Q9UBU2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DKK2Q9UBU2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DKK2Q9UBU2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DKK2Q9UBU2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DKK2Q9UBU2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DKK2Q9UBU2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DKK2Q9UBU2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DKK2Q9UBU2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DKK2Q9UBU2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DKK2Q9UBU2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DKK2Q9UBU2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DKK2Q9UBU2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DKK2Q9UBU2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DKK2Q9UBU2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DKK2Q9UBU2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms