Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA2D2Q9NY47 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA2D2Q9NY47 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA2D2Q9NY47 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA2D2Q9NY47 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNA2D2Q9NY47 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNA2D2Q9NY47 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNA2D2Q9NY47 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNA2D2Q9NY47 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNA2D2Q9NY47 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNA2D2Q9NY47 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA2D2Q9NY47 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA2D2Q9NY47 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA2D2Q9NY47 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA2D2Q9NY47 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA2D2Q9NY47 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA2D2Q9NY47 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA2D2Q9NY47 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA2D2Q9NY47 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA2D2Q9NY47 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA2D2Q9NY47 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA2D2Q9NY47 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNA2D2Q9NY47 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNA2D2Q9NY47 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNA2D2Q9NY47 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNA2D2Q9NY47 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNA2D2Q9NY47 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNA2D2Q9NY47 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNA2D2Q9NY47 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNA2D2Q9NY47 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNA2D2Q9NY47 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNA2D2Q9NY47 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNA2D2Q9NY47 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNA2D2Q9NY47 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNA2D2Q9NY47 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNA2D2Q9NY47 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA2D2Q9NY47 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA2D2Q9NY47 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNA2D2Q9NY47 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA2D2Q9NY47 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA2D2Q9NY47 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA2D2Q9NY47 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA2D2Q9NY47 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA2D2Q9NY47 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNA2D2Q9NY47 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNA2D2Q9NY47 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNA2D2Q9NY47 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA2D2Q9NY47 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA2D2Q9NY47 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA2D2Q9NY47 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA2D2Q9NY47 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA2D2Q9NY47 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA2D2Q9NY47 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA2D2Q9NY47 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA2D2Q9NY47 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA2D2Q9NY47 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA2D2Q9NY47 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA2D2Q9NY47 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA2D2Q9NY47 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA2D2Q9NY47 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA2D2Q9NY47 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CACNA2D2Q9NY47 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA2D2Q9NY47 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA2D2Q9NY47 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA2D2Q9NY47 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA2D2Q9NY47 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA2D2Q9NY47 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA2D2Q9NY47 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CACNA2D2Q9NY47 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CACNA2D2Q9NY47 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CACNA2D2Q9NY47 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CACNA2D2Q9NY47 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CACNA2D2Q9NY47 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNA2D2Q9NY47 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CACNA2D2Q9NY47 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA2D2Q9NY47 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA2D2Q9NY47 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA2D2Q9NY47 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA2D2Q9NY47 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA2D2Q9NY47 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNA2D2Q9NY47 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNA2D2Q9NY47 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNA2D2Q9NY47 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA2D2Q9NY47 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA2D2Q9NY47 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA2D2Q9NY47 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA2D2Q9NY47 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA2D2Q9NY47 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA2D2Q9NY47 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNA2D2Q9NY47 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNA2D2Q9NY47 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA2D2Q9NY47 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA2D2Q9NY47 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA2D2Q9NY47 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA2D2Q9NY47 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA2D2Q9NY47 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA2D2Q9NY47 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA2D2Q9NY47 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNA2D2Q9NY47 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms