Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHCHD3Q9NX63 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHCHD3Q9NX63 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHCHD3Q9NX63 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHCHD3Q9NX63 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHCHD3Q9NX63 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHCHD3Q9NX63 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHCHD3Q9NX63 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHCHD3Q9NX63 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHCHD3Q9NX63 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHCHD3Q9NX63 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHCHD3Q9NX63 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHCHD3Q9NX63 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHCHD3Q9NX63 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHCHD3Q9NX63 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHCHD3Q9NX63 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHCHD3Q9NX63 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHCHD3Q9NX63 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHCHD3Q9NX63 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHCHD3Q9NX63 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHCHD3Q9NX63 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHCHD3Q9NX63 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CHCHD3Q9NX63 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHCHD3Q9NX63 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHCHD3Q9NX63 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHCHD3Q9NX63 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHCHD3Q9NX63 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHCHD3Q9NX63 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHCHD3Q9NX63 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHCHD3Q9NX63 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHCHD3Q9NX63 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHCHD3Q9NX63 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHCHD3Q9NX63 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHCHD3Q9NX63 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHCHD3Q9NX63 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHCHD3Q9NX63 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHCHD3Q9NX63 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHCHD3Q9NX63 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHCHD3Q9NX63 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHCHD3Q9NX63 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHCHD3Q9NX63 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHCHD3Q9NX63 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHCHD3Q9NX63 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHCHD3Q9NX63 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHCHD3Q9NX63 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHCHD3Q9NX63 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHCHD3Q9NX63 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHCHD3Q9NX63 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHCHD3Q9NX63 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHCHD3Q9NX63 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHCHD3Q9NX63 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHCHD3Q9NX63 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHCHD3Q9NX63 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHCHD3Q9NX63 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHCHD3Q9NX63 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHCHD3Q9NX63 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHCHD3Q9NX63 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHCHD3Q9NX63 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHCHD3Q9NX63 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHCHD3Q9NX63 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHCHD3Q9NX63 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHCHD3Q9NX63 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHCHD3Q9NX63 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHCHD3Q9NX63 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHCHD3Q9NX63 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHCHD3Q9NX63 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHCHD3Q9NX63 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHCHD3Q9NX63 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHCHD3Q9NX63 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHCHD3Q9NX63 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHCHD3Q9NX63 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHCHD3Q9NX63 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHCHD3Q9NX63 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHCHD3Q9NX63 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHCHD3Q9NX63 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHCHD3Q9NX63 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHCHD3Q9NX63 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHCHD3Q9NX63 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHCHD3Q9NX63 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHCHD3Q9NX63 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHCHD3Q9NX63 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHCHD3Q9NX63 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHCHD3Q9NX63 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHCHD3Q9NX63 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHCHD3Q9NX63 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHCHD3Q9NX63 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHCHD3Q9NX63 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHCHD3Q9NX63 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHCHD3Q9NX63 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHCHD3Q9NX63 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHCHD3Q9NX63 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHCHD3Q9NX63 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHCHD3Q9NX63 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHCHD3Q9NX63 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHCHD3Q9NX63 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHCHD3Q9NX63 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHCHD3Q9NX63 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHCHD3Q9NX63 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHCHD3Q9NX63 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHCHD3Q9NX63 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms