Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW6

NMRK1, Nicotinamide riboside kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMRK1Q9NWW6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NMRK1Q9NWW6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NMRK1Q9NWW6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NMRK1Q9NWW6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NMRK1Q9NWW6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NMRK1Q9NWW6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NMRK1Q9NWW6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NMRK1Q9NWW6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NMRK1Q9NWW6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NMRK1Q9NWW6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NMRK1Q9NWW6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NMRK1Q9NWW6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NMRK1Q9NWW6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NMRK1Q9NWW6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NMRK1Q9NWW6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NMRK1Q9NWW6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NMRK1Q9NWW6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NMRK1Q9NWW6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NMRK1Q9NWW6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NMRK1Q9NWW6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NMRK1Q9NWW6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NMRK1Q9NWW6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NMRK1Q9NWW6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NMRK1Q9NWW6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NMRK1Q9NWW6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NMRK1Q9NWW6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NMRK1Q9NWW6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NMRK1Q9NWW6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NMRK1Q9NWW6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NMRK1Q9NWW6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NMRK1Q9NWW6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NMRK1Q9NWW6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NMRK1Q9NWW6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NMRK1Q9NWW6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NMRK1Q9NWW6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NMRK1Q9NWW6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NMRK1Q9NWW6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NMRK1Q9NWW6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NMRK1Q9NWW6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NMRK1Q9NWW6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NMRK1Q9NWW6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NMRK1Q9NWW6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NMRK1Q9NWW6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NMRK1Q9NWW6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NMRK1Q9NWW6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NMRK1Q9NWW6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NMRK1Q9NWW6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NMRK1Q9NWW6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NMRK1Q9NWW6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NMRK1Q9NWW6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NMRK1Q9NWW6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NMRK1Q9NWW6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NMRK1Q9NWW6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NMRK1Q9NWW6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NMRK1Q9NWW6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NMRK1Q9NWW6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NMRK1Q9NWW6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NMRK1Q9NWW6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NMRK1Q9NWW6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NMRK1Q9NWW6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NMRK1Q9NWW6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NMRK1Q9NWW6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NMRK1Q9NWW6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NMRK1Q9NWW6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NMRK1Q9NWW6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NMRK1Q9NWW6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NMRK1Q9NWW6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NMRK1Q9NWW6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NMRK1Q9NWW6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NMRK1Q9NWW6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NMRK1Q9NWW6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NMRK1Q9NWW6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NMRK1Q9NWW6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NMRK1Q9NWW6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NMRK1Q9NWW6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NMRK1Q9NWW6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NMRK1Q9NWW6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NMRK1Q9NWW6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NMRK1Q9NWW6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NMRK1Q9NWW6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NMRK1Q9NWW6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NMRK1Q9NWW6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NMRK1Q9NWW6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NMRK1Q9NWW6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NMRK1Q9NWW6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NMRK1Q9NWW6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NMRK1Q9NWW6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NMRK1Q9NWW6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NMRK1Q9NWW6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NMRK1Q9NWW6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NMRK1Q9NWW6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NMRK1Q9NWW6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NMRK1Q9NWW6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NMRK1Q9NWW6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NMRK1Q9NWW6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NMRK1Q9NWW6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NMRK1Q9NWW6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NMRK1Q9NWW6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NMRK1Q9NWW6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NMRK1Q9NWW6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms