Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASF1BQ9NVP2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ASF1BQ9NVP2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ASF1BQ9NVP2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ASF1BQ9NVP2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASF1BQ9NVP2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASF1BQ9NVP2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASF1BQ9NVP2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASF1BQ9NVP2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ASF1BQ9NVP2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ASF1BQ9NVP2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ASF1BQ9NVP2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASF1BQ9NVP2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASF1BQ9NVP2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ASF1BQ9NVP2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASF1BQ9NVP2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASF1BQ9NVP2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ASF1BQ9NVP2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ASF1BQ9NVP2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASF1BQ9NVP2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASF1BQ9NVP2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASF1BQ9NVP2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASF1BQ9NVP2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASF1BQ9NVP2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASF1BQ9NVP2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASF1BQ9NVP2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASF1BQ9NVP2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASF1BQ9NVP2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASF1BQ9NVP2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ASF1BQ9NVP2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASF1BQ9NVP2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASF1BQ9NVP2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASF1BQ9NVP2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASF1BQ9NVP2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASF1BQ9NVP2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASF1BQ9NVP2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASF1BQ9NVP2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASF1BQ9NVP2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASF1BQ9NVP2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASF1BQ9NVP2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASF1BQ9NVP2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASF1BQ9NVP2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASF1BQ9NVP2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASF1BQ9NVP2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASF1BQ9NVP2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASF1BQ9NVP2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASF1BQ9NVP2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASF1BQ9NVP2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASF1BQ9NVP2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASF1BQ9NVP2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASF1BQ9NVP2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASF1BQ9NVP2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ASF1BQ9NVP2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ASF1BQ9NVP2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ASF1BQ9NVP2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASF1BQ9NVP2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASF1BQ9NVP2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASF1BQ9NVP2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASF1BQ9NVP2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASF1BQ9NVP2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASF1BQ9NVP2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASF1BQ9NVP2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASF1BQ9NVP2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASF1BQ9NVP2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASF1BQ9NVP2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASF1BQ9NVP2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASF1BQ9NVP2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASF1BQ9NVP2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASF1BQ9NVP2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASF1BQ9NVP2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASF1BQ9NVP2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ASF1BQ9NVP2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASF1BQ9NVP2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASF1BQ9NVP2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASF1BQ9NVP2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASF1BQ9NVP2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASF1BQ9NVP2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASF1BQ9NVP2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASF1BQ9NVP2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASF1BQ9NVP2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ASF1BQ9NVP2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ASF1BQ9NVP2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ASF1BQ9NVP2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASF1BQ9NVP2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASF1BQ9NVP2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASF1BQ9NVP2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASF1BQ9NVP2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ASF1BQ9NVP2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASF1BQ9NVP2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ASF1BQ9NVP2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ASF1BQ9NVP2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ASF1BQ9NVP2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASF1BQ9NVP2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ASF1BQ9NVP2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASF1BQ9NVP2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASF1BQ9NVP2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASF1BQ9NVP2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASF1BQ9NVP2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASF1BQ9NVP2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASF1BQ9NVP2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms