Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DEPPQ9NTK1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DEPPQ9NTK1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DEPPQ9NTK1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DEPPQ9NTK1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DEPPQ9NTK1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DEPPQ9NTK1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DEPPQ9NTK1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DEPPQ9NTK1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DEPPQ9NTK1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DEPPQ9NTK1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DEPPQ9NTK1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DEPPQ9NTK1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DEPPQ9NTK1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DEPPQ9NTK1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DEPPQ9NTK1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DEPPQ9NTK1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DEPPQ9NTK1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DEPPQ9NTK1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DEPPQ9NTK1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DEPPQ9NTK1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DEPPQ9NTK1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DEPPQ9NTK1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DEPPQ9NTK1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEPPQ9NTK1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEPPQ9NTK1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DEPPQ9NTK1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DEPPQ9NTK1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DEPPQ9NTK1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DEPPQ9NTK1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DEPPQ9NTK1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DEPPQ9NTK1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DEPPQ9NTK1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DEPPQ9NTK1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DEPPQ9NTK1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DEPPQ9NTK1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DEPPQ9NTK1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DEPPQ9NTK1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DEPPQ9NTK1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DEPPQ9NTK1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DEPPQ9NTK1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DEPPQ9NTK1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DEPPQ9NTK1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEPPQ9NTK1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEPPQ9NTK1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DEPPQ9NTK1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DEPPQ9NTK1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DEPPQ9NTK1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DEPPQ9NTK1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DEPPQ9NTK1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DEPPQ9NTK1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DEPPQ9NTK1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DEPPQ9NTK1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEPPQ9NTK1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEPPQ9NTK1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEPPQ9NTK1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEPPQ9NTK1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DEPPQ9NTK1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DEPPQ9NTK1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DEPPQ9NTK1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DEPPQ9NTK1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DEPPQ9NTK1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DEPPQ9NTK1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DEPPQ9NTK1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DEPPQ9NTK1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEPPQ9NTK1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DEPPQ9NTK1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DEPPQ9NTK1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DEPPQ9NTK1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DEPPQ9NTK1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DEPPQ9NTK1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DEPPQ9NTK1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DEPPQ9NTK1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DEPPQ9NTK1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEPPQ9NTK1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEPPQ9NTK1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEPPQ9NTK1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEPPQ9NTK1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEPPQ9NTK1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEPPQ9NTK1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEPPQ9NTK1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPPQ9NTK1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPPQ9NTK1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPPQ9NTK1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPPQ9NTK1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEPPQ9NTK1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEPPQ9NTK1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEPPQ9NTK1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEPPQ9NTK1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEPPQ9NTK1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEPPQ9NTK1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEPPQ9NTK1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEPPQ9NTK1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DEPPQ9NTK1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DEPPQ9NTK1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DEPPQ9NTK1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DEPPQ9NTK1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DEPPQ9NTK1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPPQ9NTK1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPPQ9NTK1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms