Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
RRP7BPQ9NSQ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
RRP7BPQ9NSQ0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
RRP7BPQ9NSQ0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
RRP7BPQ9NSQ0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
RRP7BPQ9NSQ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
RRP7BPQ9NSQ0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
RRP7BPQ9NSQ0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
RRP7BPQ9NSQ0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
RRP7BPQ9NSQ0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
RRP7BPQ9NSQ0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
RRP7BPQ9NSQ0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
RRP7BPQ9NSQ0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
RRP7BPQ9NSQ0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
RRP7BPQ9NSQ0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
RRP7BPQ9NSQ0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
RRP7BPQ9NSQ0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
RRP7BPQ9NSQ0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
RRP7BPQ9NSQ0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
RRP7BPQ9NSQ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
RRP7BPQ9NSQ0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
RRP7BPQ9NSQ0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
RRP7BPQ9NSQ0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
RRP7BPQ9NSQ0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
RRP7BPQ9NSQ0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
RRP7BPQ9NSQ0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
RRP7BPQ9NSQ0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
RRP7BPQ9NSQ0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
RRP7BPQ9NSQ0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
RRP7BPQ9NSQ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
RRP7BPQ9NSQ0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
RRP7BPQ9NSQ0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
RRP7BPQ9NSQ0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
RRP7BPQ9NSQ0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
RRP7BPQ9NSQ0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
RRP7BPQ9NSQ0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
RRP7BPQ9NSQ0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
RRP7BPQ9NSQ0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
RRP7BPQ9NSQ0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
RRP7BPQ9NSQ0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
RRP7BPQ9NSQ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
RRP7BPQ9NSQ0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
RRP7BPQ9NSQ0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.93■■■■■ 4.14
RRP7BPQ9NSQ0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.91■■■■■ 4.14
RRP7BPQ9NSQ0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
RRP7BPQ9NSQ0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
RRP7BPQ9NSQ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
RRP7BPQ9NSQ0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
RRP7BPQ9NSQ0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
RRP7BPQ9NSQ0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
RRP7BPQ9NSQ0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
RRP7BPQ9NSQ0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
RRP7BPQ9NSQ0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
RRP7BPQ9NSQ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
RRP7BPQ9NSQ0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
RRP7BPQ9NSQ0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
RRP7BPQ9NSQ0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
RRP7BPQ9NSQ0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
RRP7BPQ9NSQ0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
RRP7BPQ9NSQ0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
RRP7BPQ9NSQ0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
RRP7BPQ9NSQ0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
RRP7BPQ9NSQ0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
RRP7BPQ9NSQ0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
RRP7BPQ9NSQ0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
RRP7BPQ9NSQ0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
RRP7BPQ9NSQ0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
RRP7BPQ9NSQ0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
RRP7BPQ9NSQ0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
RRP7BPQ9NSQ0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
RRP7BPQ9NSQ0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
RRP7BPQ9NSQ0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
RRP7BPQ9NSQ0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
RRP7BPQ9NSQ0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.71■■■■■ 4.11
RRP7BPQ9NSQ0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
RRP7BPQ9NSQ0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
RRP7BPQ9NSQ0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
RRP7BPQ9NSQ0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
RRP7BPQ9NSQ0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
RRP7BPQ9NSQ0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms