Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TIMMDC1Q9NPL8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TIMMDC1Q9NPL8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TIMMDC1Q9NPL8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TIMMDC1Q9NPL8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TIMMDC1Q9NPL8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TIMMDC1Q9NPL8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TIMMDC1Q9NPL8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMMDC1Q9NPL8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMMDC1Q9NPL8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TIMMDC1Q9NPL8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TIMMDC1Q9NPL8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TIMMDC1Q9NPL8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TIMMDC1Q9NPL8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TIMMDC1Q9NPL8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TIMMDC1Q9NPL8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIMMDC1Q9NPL8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIMMDC1Q9NPL8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIMMDC1Q9NPL8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TIMMDC1Q9NPL8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TIMMDC1Q9NPL8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TIMMDC1Q9NPL8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TIMMDC1Q9NPL8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TIMMDC1Q9NPL8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TIMMDC1Q9NPL8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TIMMDC1Q9NPL8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TIMMDC1Q9NPL8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMMDC1Q9NPL8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TIMMDC1Q9NPL8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TIMMDC1Q9NPL8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TIMMDC1Q9NPL8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TIMMDC1Q9NPL8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TIMMDC1Q9NPL8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TIMMDC1Q9NPL8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TIMMDC1Q9NPL8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TIMMDC1Q9NPL8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIMMDC1Q9NPL8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TIMMDC1Q9NPL8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TIMMDC1Q9NPL8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TIMMDC1Q9NPL8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TIMMDC1Q9NPL8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TIMMDC1Q9NPL8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TIMMDC1Q9NPL8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TIMMDC1Q9NPL8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TIMMDC1Q9NPL8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TIMMDC1Q9NPL8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TIMMDC1Q9NPL8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TIMMDC1Q9NPL8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TIMMDC1Q9NPL8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TIMMDC1Q9NPL8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TIMMDC1Q9NPL8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TIMMDC1Q9NPL8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TIMMDC1Q9NPL8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TIMMDC1Q9NPL8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIMMDC1Q9NPL8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIMMDC1Q9NPL8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIMMDC1Q9NPL8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIMMDC1Q9NPL8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TIMMDC1Q9NPL8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TIMMDC1Q9NPL8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TIMMDC1Q9NPL8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TIMMDC1Q9NPL8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TIMMDC1Q9NPL8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TIMMDC1Q9NPL8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIMMDC1Q9NPL8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIMMDC1Q9NPL8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIMMDC1Q9NPL8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TIMMDC1Q9NPL8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIMMDC1Q9NPL8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIMMDC1Q9NPL8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIMMDC1Q9NPL8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMMDC1Q9NPL8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMMDC1Q9NPL8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIMMDC1Q9NPL8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIMMDC1Q9NPL8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TIMMDC1Q9NPL8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIMMDC1Q9NPL8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMMDC1Q9NPL8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMMDC1Q9NPL8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMMDC1Q9NPL8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIMMDC1Q9NPL8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIMMDC1Q9NPL8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIMMDC1Q9NPL8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIMMDC1Q9NPL8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIMMDC1Q9NPL8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMMDC1Q9NPL8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMMDC1Q9NPL8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMMDC1Q9NPL8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMMDC1Q9NPL8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms